如何在RStudio中运行Python脚本

Question

我有一个问题，如何从Rstudio运行Python脚本？

我的初始想法是从GitHub存储库中获取Python脚本，然后在R中运行它。通过RCurl包中的script <- getURL(URL, ssl.verifypeer = FALSE)命令，我获取了Python代码，但我不知道如何在不将脚本存储为工作目录中的文件的情况下在Rstudio中运行变量 script 。

我确实知道可以使用_rPython_包中的python.load()帮助运行Python脚本，但它需要将.py文件作为第一个参数。 而我想找到一种不将Python脚本存储为文件的方法。

如果您有任何关于这个问题的想法，谢谢提前告知。

- twang

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你能告诉我更多关于获取script对象的URL吗？script对象是什么样子的？ - Fred Boehm

请查看reticulate软件包：https://blog.rstudio.com/2018/03/26/reticulate-r-interface-to-python/гЂ‚ - ngm

如果您下载了脚本，那么您只需要输入 system("python path/to/script.py") 即可。 - lefft

@FredBoehm，可以通过单击Github存储库中的“Raw”按钮来查找任何Python代码的URL，例如链接，而script <- getURL（URL，ssl.verifypeer = FALSE）中的script是一个字符向量，它包含该URL中的所有内容（代码）。 - twang

我正在为reticulate添加URL源支持（Github拉取请求在此处）。一旦合并，您就可以直接使用reticulate::source_python()进行源操作。 - Yuan Tang

Answer 1

请确保您正在运行一个R Markdown文件，并且已经安装了reticulate。

加载并配置您的Python版本：

```{r setup, include = FALSE}
library(reticulate)
use_python("usr/local/bin/python")
```

然后，任何Python代码都可以按照以下方式调用：

```{python}
# write python
# code here
```

如果您创建了任何全局的Python对象并想要在R代码中使用它们，只需在前面加上py$即可；例如，在R块中访问由Python创建的名为my_data的数据框：

```{r}
head(py$my_data)
```

更多详情请点击此处。

- Jared Wilber

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很好的开始。有没有一种方法可以调用带参数的脚本并只获取Python脚本的标准输出？例如，py_output <- %run ./mypythonscript.py arg1 arg2 ... ？ - sAguinaga

我刚刚发现了这个：https://github.com/rstudio/reticulate。"源Python脚本-source_python()函数使您能够以与souce() R脚本相同的方式源Python脚本（在脚本中定义的Python函数和对象直接可用于R会话）。 - sAguinaga