GraphML图的可视化？

Question

如何在Mac OSX或Linux上将GraphML定义的图形可视化？根据gremlin-users group，R + iGraph似乎是一个有效的解决方案，但我想知道是否有更简单的解决方案，最好是一个简单的“graphml2png”命令行应用程序。有任何想法吗？

- Jerome Serrano

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GraphMl viewer用于网络可视化 示例。 - Abhi

Answer 1

我使用yEd，它可以在Linux、Windows和OSX上运行，并且可以导出多种格式，例如PDF、PNG、SVG、BMP等等。

不幸的是，据我所知它没有命令行支持。

- Massimo Callegari

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很好！它似乎有一些错误，当我们点击它们时，它不会显示一些东西，其他时候则需要几次重试才能显示。主要提示是“聚焦节点”，在“邻域”或“前驱”上右键单击并“转换为文档”，这将让我们放大以进行进一步分析。谢谢！ - Aquarius Power

Answer 2

我没有完整的配方，但我可以分享一下我的想法。

由于图形可以以许多方式进行可视化，因此您应该能够以某种方式管理其外观。仅仅绘制节点和边缘而没有任何预处理不是一个好选择 - 这种方法将给您一个随机的边缘和节点，特别是在大型图形上。

以下是一个示例算法，用于获得图形的清晰且视觉上吸引人的表示：

1. 在图形上运行一些力导向算法。
2. 计算图形模块性并按其模块化类别对每个节点进行着色。
3. 根据其度数更改每个节点的大小。
4. 如果图形太大，请过滤掉您不感兴趣的节点（可能是低度节点）。
5. 根据它们的权重更改边缘粗细。
6. 添加标签到节点和边缘。

您可以使用 Gephi（手动模式）执行此类操作。他们还提供了一个Gephi Toolkit，应该能够自动化这些操作（不幸的是，我自己还没有尝试过）。所以我会尝试编写一个简单的控制台Java程序，使用这个工具包。

这是一个使用上述算法可视化的图形示例：

- Sergey Kolodiy

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我们是否有任何关于Web应用程序的解决方案？我想制作一个Angular应用程序，与D3.js或Cytoscape可视化，但所有工作都需要CSV或JSON，您知道任何将GraphML转换为JSON或CSV的库吗？ - Amir-Mousavi

GraphMl视图器用于网络可视化 示例。 - Abhi