Python和Rpy2：调用具有"."的选项的绘图函数

Question

我刚开始学习如何使用python的rpy2。我能够制作简单的图表等，但是我遇到了一个问题，即R中的许多选项使用“.”。例如，下面是一个有效的R调用：

barplot(t, col=heat.colors(2), names.arg=c("pwn", "pwn2"))

其中t是一个矩阵。

我想在python中使用相同的调用，但它拒绝了names.arg中的“.”部分。我的理解是，在python中，您将“.”替换为“_”，例如names_arg，但这也不起作用。我知道这是一个基本的问题，所以我希望有人看到并知道解决方法。谢谢！

- Andy Hall

Answer 1

你可以在这里使用字典来代替命名参数（使用 **），如文档中所描述的，然后直接调用R函数。同时请记住，RPy2需要其自己的向量对象。是的，这有点尴尬，但好处是你应该能够在rpy2中做任何你在R中能做的事情。

from rpy2 import robjects
color = robjects.r("heat.colors")()
names = robjects.StrVector(("pwn", "pwn2"))
robjects.r.barplot(t, col=color, **{"names.arg":names})

请注意，此处针对的是rpy2版本2.0.x；在未发布的2.1版中有一些变化，我还没有机会去看。

- Noah

Answer 2

我不知道Rpy是否会接受这个，但是你可以在关键字参数中使用句点。不过你必须通过一个字典来传递它们。像这样：

>>> def f(**kwds): print kwds
... 
>>> f(a=5, b_c=6)
{'a': 5, 'b_c': 6}
>>> f(a=5, b.c=6)
Traceback (  File "<interactive input>", line 1
SyntaxError: keyword cant be an expression (<interactive input>, line 1)
>>> f(**{'a': 5, 'b.c': 6})
{'a': 5, 'b.c': 6}

- Max Shawabkeh

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这真的很有帮助，特别是结合第二个答案一起使用。现在已经全部解决了，谢谢！ - Andy Hall

Answer 3

使用rpy2-2.1.0，编写它的一种方法是：

from rpy2.robjects.packages import importr
graphics = importr("graphics")
grdevices = importr("grDevices")

graphics.barplot_default(t, 
                         col = grdevices.heat_colors(2),
                         names_arg = StrVector(("pwn", "pwn2")))

需要使用barplot_default（而不是barplot）是由于R函数签名中广泛使用省略号“...”以及保存参数名称翻译需要分析函数包含的R代码。

更多信息和一个执行将“.”系统翻译为“_”的函数示例，请参见： http://rpy.sourceforge.net/rpy2/doc-2.1/html/robjects.html#functions

- user258198