如何调整RMarkdown页面大小以适应大图（非缩放igraph）

Question

我需要在RMarkdown文档中放置一个大的igraph图，但是许多节点和标签重叠（类似于下面的图片）。

我想使用'rescale=FALSE'参数可以解决问题，但是问题是无论fig.height、fig.width选项如何设置，绘图大小都大于页面大小。

下面是一个可重现的示例（保存为.Rmd并Knit）：

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output: pdf_document
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# How to resize page to fit plot?
```{r pressure, echo=FALSE, fig.height=20, fig.width=20, message=FALSE, warning=FALSE}
library(igraph)
st <- make_star(500)
set.seed(100)
plot(st, vertex.size=10, vertex.label=NA, rescale=FALSE) 
```

有一种方法可以将页面大小调整为非缩放的igraph吗？

- Gorka

Answer 1

您可以通过在YAML中添加classoption来调整页面大小。但是，您还可以通过调整图形大小以及使用xlim()和ylim()来调整页面内的图形大小，详见此处的回答。

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output:
  pdf_document:
documentclass: article
classoption:
  - a1paper
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# How to resize page to fit plot?
```{r pressure, echo=FALSE, fig.height=30, fig.width=40, message=FALSE, warning=FALSE}
library(igraph)
st <- make_star(500)
set.seed(100)
plot(st, vertex.size=10, ylim=c(3,5), xlim = c(-7, 15),vertex.label=NA, rescale=FALSE)
```

- Willian Vieira

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非常棒的答案，关于使用igraph中的“layout_as_tree”绘制决策树时提供了非常有用的信息。你帮我省去了很多查找源代码的时间。 - Gabe Church