Ade4软件包 - 主成分分析

Question

我打算进行一些主成分分析，我正在使用这个PCA教程作为指南。我有以下代码：

library("ade4")
Data <- read.table("D:/Bla/Data1.txt", header = TRUE, sep="\t")    
plot(Data$X, Data$Y)
pc <- dudi.pca(Data, scale = FALSE, scan = FALSE)    
pc$eig

然而，我得到的特征值和教程中的不一样。是我做错了还是dudi.pca存在已知的问题？顺便问一下，如何获取特征向量？

附注：

我使用了这些数据：

X   Y
2.5 2.4
0.5 0.7
2.2 2.9
1.9 2.2
3.1 3
2.3 2.7
2   1.6
1   1.1
1.5 1.6
1.1 0.9

这段代码使用 dudi.pca 对数据进行标准化，通过减去均值实现。

- cs0815

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我刚刚注意到它正确地执行了PCA，但通过减去平均值并除以标准差来归一化数据。 - cs0815

Answer 1

在你提供的PDF文件中，特征值是通过以下命令获得的：

eigen(cov(Data))

而来自 dudi.pca 的特征值（我猜测）则来自于居中和缩放后的协方差矩阵。

- csgillespie