Python函数实现双向重复测量ANOVA

Question

非常感谢您的回答。我想在Python中进行双向重复测量的ANOVA，其中一个自变量有5个水平，另一个自变量有4个水平，只有一个因变量。我已经尝试在scipy文档和一些在线博客中查找，但似乎找不到任何有用的信息。

- DGMC90

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据我所知，scipy中尚未完全实现混合效应和分层模型。有一个未完成的混合效应沙盒模块，但我不知道结果有多准确。如果您愿意，可以研究PyStan。它需要更多的编码工作，但您可以分析任何您想到的模型。 - Nate

谢谢 - 我会去查看的。 - DGMC90

Answer 1

您可以使用Pingouin软件包中的rm_anova函数（我是该软件包的创建者），它可直接与pandas DataFrame配合使用，例如： （详见此）。

import pingouin as pg

# Compute the 2-way repeated measures ANOVA. This will return a dataframe.
pg.rm_anova(dv='dv', within=['iv1', 'iv2'], subject='id', data=df)

# Optional post-hoc tests
pg.pairwise_ttests(dv='dv', within=['iv1', 'iv2'], subject='id', data=df)

- Raphael

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我该如何检查球形和正态等假设是否得到满足？我发现只有单向重复测量ANOVA的方法已经实现。 - Shiv Patel

Answer 2

这是一个老问题，但我会提供一个答案。

你可以看一下pyvttbl。使用这个库（可以通过Pip安装），您可以进行独立和重复测量（以及混合设计）的n-way ANOVA。请注意，似乎您将需要使用Pyvttbl自己的数据框方法来处理您的数据。

非常简单：

dataframe.anova('dv', sub='id', wfactors=['iv1',      'iv2'])

你可以查看我的博客文章，了解如何进行重复测量的2路方差分析的更详细示例。 （链接）

- Erik Marsja