在 Jupyter Notebook 中无法导入模块；sys.path 错误

Question

在 Jupyter Notebook 中无法导入模块；sys.path 错误

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我在我的iPython/Jupyter笔记本中导入模块时遇到了问题。问题根本上在于sys.path指向的位置。

从iPython/Jupyter笔记本中，sys.executable返回：

'/usr/bin/python'

然而，从命令行执行它时，返回的结果为：

'//anaconda/bin/python'

我已经尝试卸载和重新安装Anaconda，但问题仍存在。

我还尝试在bash_profile中增加$PYTHONPATH以包括//anaconda/bin/python，但这并没有解决问题。

有没有办法永久地更改Jupyter Notebook中的sys.path，而不仅仅是使用sys.path.append(...)？

- runawaykid

sys.executable和sys.path是两个不同的东西。https://docs.python.org/2/library/sys.html - caoanan

@runawaykid，你想接受任何一个答案吗？ - user3521099

6个回答

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Open a new terminal window and see if this helps. If not, proceed with 2.
Start a standard Python session from the terminal and type this:
```
>>> import sys
>>> sys.executable
```

Do the same in the notebook:

In [1]: import sys
        sys.executable

Compare the results. Hopefully, this gives you a clue what is going on.

- Mike Müller

2

从终端中，我得到了：'/Users/---/anaconda/bin/python' 从笔记本中，我得到了：'/usr/bin/python'您能给我一些建议，说明这意味着什么，以及我现在应该怎么做吗？ - runawaykid

1

尝试使用/Users/---/anaconda/bin/python/jupyter notebook。 - Mike Müller

1

这将在相同的根环境中启动Jupyter笔记本，但会导致类似的不同sys.path。 - runawaykid

抱歉，请使用：/Users/---/anaconda/bin/jupyter notebook。 - Mike Müller

再试一次：hash -r - Mike Müller

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我的系统是Mac。我遇到了相同的问题。

我使用anaconda python安装了一些包，但是我的jupyter笔记本没有使用它们，也无法导入这些模块。我通过以下步骤解决了这个问题：

步骤1：检查你用来安装包的实际python路径

我执行了命令which python，它显示了我用来安装包的默认python路径：

➜  ~ which python
/Users/my_name/opt/anaconda3/bin/python

步骤2：更改jupyter内核的python路径为上述路径

我运行jupyter kernelspec list，它显示我的jupyter notebook可用的2个内核：

Available kernels:
  python3    /Users/my_name/Library/Jupyter/kernels/python3
  python2    /usr/local/share/jupyter/kernels/python2

由于我通常在jupyter中使用python3，所以我选择编辑第一个内核的配置，运行: vi /Users/my_name/Library/Jupyter/kernels/python3/kernel.json

将第一个路径替换为"/Users/my_name/opt/anaconda3/bin/python"(根据which python命令显示).

{
 "argv": [
  "/Users/my_name/opt/anaconda3/bin/python",
  "-m",
  "ipykernel_launcher",
  "-f",
  "{connection_file}"
 ],
 "display_name": "heterodimers",
 "language": "python"
}

保存并退出kernel.json文件。

之后，我的jupyter notebook可以导入我在终端中安装的包。

感谢Mike的回答，因为我基本上按照他的解决方案找到了我的解决方法。不同之处在于我没有使用conda环境。

- Seraph

1

以上答案均未解决我的问题。在我的Windows系统中，我尝试了这个方法并且它起作用了。

conda create --name {envname}
conda install ipykernel --name {envname}
python -m ipykernel install --prefix=C:/anaconda/envs/{envname} --name {envname}
activate envname
pip install jupyter

检查笔记本中的sys.executable，以确保你的前缀在输出中提到。

- Rishabh Kumar

0

我刚遇到了这个问题。做了

find ~ -name kernal.json

并获得

/home/mee/dev/my-venv1/__venv__/share/jupyter/kernels/python3/kernel.json
/home/mee/dev/my-venv2/__venv__/share/jupyter/kernels/python3/kernel.json
/home/mee/.local/share/jupyter/kernels/python3/kernel.json

我查看了~/.local/share/jupyter/kernels/python3/kernel.json，发现它指向/home/alex/dev/my-venv2/__venv__/bin/python3。

我删除了~/.local/share/jupyter/kernels/python3/kernel.json，现在my-venv2中的那个指向正确的位置，所有功能正常。

- CpILL

0

win11，miniconda3，virtualenv 名称“sitk”

只需运行：

conda activate sitk
conda install ipykernel
python -m ipykernel install --user --name sitk

解决在Jupyter Lab中导入SimpleITK时出现的错误问题

- Kai-Nan Shao

网页内容由stack overflow 提供, 点击上面的

可以查看英文原文，
原文链接

- user3521099 · Accepted Answer

我也遇到了同样的问题。在尝试了很多其他地方找到的解决方案后，我终于想出了一个在我的情况下至少能够工作的解决方案。

步骤1：检查anaconda环境的正确可执行路径。

进入命令行，激活有问题的conda环境，并检查环境的正确可执行路径。

conda activate {envronment name};
然后在python控制台上， (>>>)import sys;sys.executable

例如，在Linux上，它将是 /media/{username}/{path-to}/anaconda3/envs/{environment name}/bin/python

步骤2：更正jupyter会话的可执行路径。

从命令行中，检查您有问题的conda环境的kernel.json文件所在的路径。

jupyter kernelspec list

例如，在Linux上，它将是：/home/{username}/.local/share/jupyter/kernels/{environment name}

打开该文件夹中的kernel.json文件，并替换错误的可执行路径，如下所示。

{
 "argv": [
  "REPLACE-THIS-WITH-THE-CORRECT-EXECUTABLE-PATH",
  "-m",
  "ipykernel_launcher",
  "-f",
  "{connection_file}"
 ],
 "display_name": "environment name",
 "language": "python"
}

希望这对你的情况也适用。