模型选择中出现错误（gamm4）dredge函数（MuMIn R包）：未识别的family，模型被跳过。

Question

模型选择中出现错误（gamm4）dredge函数（MuMIn R包）：未识别的family，模型被跳过。

3

我正在尝试使用R中的MuMIn包为广义加性混合模型（使用gamm4制作）进行模型选择。我基本上正在尝试遵循this文献中关于使用MuMIn和gamm4进行模型选择的方法。

我正在创建一个包含9个变量和一个随机个体效应的模型，如下所示：

library(gamm4)
library(MuMIn)
SouthFull = gamm4(OtoWidth ~ s(Ages) + 
                 LagFinFSLdat_AnnEsts +
                 FSL_months_Feb +
                 LagFSLdat_Annual +
                 LagFSLdat_Spring +
                 LagFSL_months_Oct+
                 FinFSLdat_SummerDat +
                 FinFSLdat_AutumnDat +
                 LagFSL_months_Nov , random = ~(1|FishName), data = South)

但是，当我尝试使用 dredge 函数时，它会出现错误信息：

(dd <- dredge(global.model=SouthFull))
Error in dredge(global.model = SouthFull) : result is empty

    In addition: There were 50 or more warnings (use warnings() to see the first 50)
    > warnings()
    Warning messages:
    1: In gamm4::gamm4(...) : family not recognized (model 1 skipped)
    ...
    50: In gamm4::gamm4(...) : family not recognized (model 50 skipped)

这是由于MuMIn无法识别gamm4模型族的问题吗？

完整的代码和数据可以在我的GitHub存储库中找到，特定问题位于gamm_analysis.R代码中，具体警告信息位于第81行。

提前致谢。

- emboylen

1

请在帖子中包含所有相关信息。 - Roman Luštrik

这样有点好些了吗？我漏掉了什么吗？ - emboylen

好的，现在我注意到你是参考MuMIn 2011年的vignette（已经被删除但显然仍可通过R-Forge的svn获得）。因此，你一定应该使用并遵循当前版本的手册。 - Kamil Bartoń

1

好的，谢谢@Kamil Barton - 我已经尝试在没有“Extgamm4.R”的情况下运行我的脚本。现在当我运行dredge（SouthFull）时，我收到错误消息：Error in nobs.default(global.model) : no 'nobs' method is available- 有什么建议吗？ - emboylen

1

你解决了问题吗？我在使用gamm4时遇到了同样的问题。"Error in nobs.default(global.model) : no 'nobs' method is available" - JMarcelino

显示剩余4条评论

1个回答

网页内容由stack overflow 提供, 点击上面的

可以查看英文原文，
原文链接

- Caryne Braga · Accepted Answer

我认为包存在问题。我遇到了同样的错误。然后，我尝试运行MumIn包中dredge函数帮助文档中提供的示例，以查看我做错了什么，但即使使用以下示例，我仍然遇到了相同的错误：

fm1 <- lm(y ~ ., data = Cement)
dd <- dredge(fm1)

错误信息是：

Error in nobs.default(global.model) : no 'nobs' method is available