使用igraph和R进行图形可视化

Question

我正在尝试使用igraph包在R中可视化图形。我希望可视化的边缘大小在2000到70,000之间。绘图看起来像这样：

这不是一个好的绘图，因为您什么也看不见。我已经想出了如何去除标签，但是由于顶点太大，仍然无法看到任何内容。

1. 我可以删除顶点只查看边吗？

例如，这里是相同的绘图，但我在完成之前拍摄了照片。似乎R只会在完成之前绘制边缘：

- CodeKingPlusPlus

Answer 1

您可以将顶点大小设置为0。

library(igraph)
g <- barabasi.game(100)
plot( g, vertex.size=0, vertex.label=NA, edge.arrow.size=0 )

- Vincent Zoonekynd

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有不同的布局算法可以指定吗？我尝试了一下，这正是我正在寻找的（奇怪的是文档中没有）。它看起来并不像上面我的图片那样。 - CodeKingPlusPlus

这个图是使用完全相同的代码生成的，没有其他任何东西。大部分参数都可以在 ?igraph.plotting 中找到，但它们必须以 vertex. 或 edge. 为前缀。根据您的图形，预设布局可能不是最佳选择（我的示例是一棵树——这很容易绘制）：您可以通过查看 ?layout 来获得完整的布局算法列表。对于绘制大型图形，许多人使用 Gephi，由于它具有交互性，可能更加灵活。 - Vincent Zoonekynd

即使使用 vertex.size=0，igraph 仍会绘制一些非常小的顶点。最好将形状设置为 none：plot(..., vertex.shape="none", vertex.size=0)。 - Gabor Csardi