在Windows 10上使用pip install xx.whl安装rpy2

Question

我想在我的笔记本上使用 rpy2 库。但是整个早上我都在安装中失败了。

这里发布了一些问题。任何建议将不胜感激！

尝试 1

使用 pip install rpy2。结果显示如下：

 Complete output from command python setup.py egg_info:
    Error: Tried to guess R's HOME but no command (R) in the PATH.

    ----------------------------------------
Command "python setup.py egg_info" failed with error code 1 in c:\users\hyf\appdata\local\temp\pip-build-gkdpb0\rpy2\  

尝试2

接着，我阅读了一些帖子。有人说使用 .whl 格式的包可以解决问题。因此，我下载了这个包并尝试使用命令 pip install rpy2-2.7.8-cp27-none-win_amd64.whl 进行安装。结果失败了：

IOError: [Errno 13] Permission denied: 'D:\\Program\\Anaconda\\Lib\\site-packages\\rpy2\\rinterface\\_rinterface.pyd'

第三次尝试

可以使用conda install --channel https://conda.binstar.org/joshadel rpy2来安装rpy2包。

但是，当我在ipython笔记本中这样调用它时：

import rpy2
from rpy2.robjects import r

结果显示错误：

RuntimeError: R_HOME not defined.

但是我已经将环境变量添加到系统变量中，就像这样：

R_HOME:D:\Program\R\bin\x64
R_User:D:\Program\Anaconda\Lib\site-packages\rpy2   

我使用带有Python2.7内核和R 3.2.2的Anaconda。

- Han Zhengzu

Answer 1

显然，R_HOME应该指向R软件的根目录，在__init__文件中，出现了以下几行代码：

# Load the R dll using the explicit path
R_DLL_DIRS = ('bin', 'lib')
# Try dirs from R_DLL_DIRS
for r_dir in R_DLL_DIRS:
    Rlib = os.path.join(R_HOME, r_dir, _win_bindir, 'R.dll')

其中_win_bindir将指代x64或32位版本。因此，您可以从shell（或更永久地在系统设置中更改）设置环境变量为：

set R_HOME=D:\Program\R

尝试在shell中使用Python（！）。

- Rorschach