如何修复ggplot2中的“离散值提供给连续比例尺”错误

Question

我想使用ggplot2绘制我在Excel中计算出的平均丰度数据和标准误差数据的柱状图。当我尝试在gglot2中绘制我的数据时，出现错误Error: Discrete value supplied to continuous scale。

我尝试直接从以逗号分隔格式（CSV）导入Excel数据，但这没有起作用，因此我尝试从头开始创建数据框架，但仍出现同样的错误。

以下是产生错误所需的最小代码。首先，我创建列数据。

Parasite <- c("Heligmosomoides", "Heligmosoma", "Trichuris",
              "Mastophorus", "Auncotheca", "Syphacia", "Tapeworms")
Mean <- c(0.166, 0.053, 0.012, 0.012, 0.0072, 0.287, 0.067)
SE <- c(0.060, 0.036, 0.012, 0.012, 0.042, 0.125, 0.026)

然后，我创建了数据帧。

DF6 <- data.frame(Parasite, Mean, SE)

然后我加载ggplot2。

library(ggplot2)

然后我使用 ggplot2 创建了具有误差线的条形图。

BGPA <- ggplot(DF6, aes(x = DF6$Parasite, y = DF6$Mean)) +
    geom_bar(color="black") +
    geom_errorbar(aes(ymin = DF6$Parasite, ymax = DF6$Mean+DF6$SE))

然后把它打印出来。

print(BGPA)

这是我遇到错误的地方。

Error: Discrete value supplied to continuous scale

- OpenSauce

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在ggplot中，去掉DF6$。并且你有ymin = Parasite，它应该是ymin = Mean - SE。 - Rui Barradas

尝试这段代码：ggplot(DF6,aes(x=Parasite,y=Mean))+geom_col(color="black")+geom_errorbar(aes(ymin=Mean-SE,ymax=Mean+SE))。通常在ggplot美学中不要使用$，因为它们使用非标准评估。 - teunbrand

谢谢，我尝试了你们两个推荐的方法，它起作用了！错误也是我使用geom_bar而不是geom_col。太棒了！ - OpenSauce

Answer 1

问题在于你将 ymin 设置为了 寄生虫 而不是 均值-标准误。另外，要么使用带有 stat = "identity" 的 geom_bar，要么使用 geom_col。

BGPA <- ggplot(DF6, aes(x = Parasite, y = Mean)) +
    geom_bar(color = "black", stat = "identity") +
    geom_errorbar(aes(ymin = Mean-SE, ymax = Mean+SE))
BGPA

- Arienrhod

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这一切都是正确的，除了出于美观目的我删除了负SE。谢谢您让我知道如何正确使用geom_bar！ - OpenSauce

没问题。如果你想去掉下侧SE，那么只需要使用 ymin = Mean 即可。 - Arienrhod