无法解决.Rmd文件中的错误<匿名>... withCallingHandlers -> withVisible -> eval -> eval ->

Question

我试图撰写一份文档，讨论使用错误来向用户传达参数问题。不幸的是，我似乎无法使.Rmd文件编织起来。一个简短的例子：

Intro text

```{r}
some_function <- function(x, y)
{
  if (x < 0) stop("x must be greater than 0")
  x + y
}

some_function(3, 2)
```

```{r}
some_function(-3, 2)
```

当我尝试将它编织成任何格式时，就会出现错误。

Quitting from lines 14-15 (test.Rmd) 
Error in some_function(-3, 2) : x < 0
Calls: <Anonymous> ... withCallingHandlers -> withVisible -> eval -> eval -> some_function

Execution halted

到目前为止，我读过的所有内容都表明这可能是因为a）没有加载软件包或b）Rmd文件中路径设置不正确而引起的问题。

由于我只在这里使用基本功能并且没有引用任何文件（至少我不知道有），所以我认为这两个问题都不是我的问题（但我很乐意错）。

您有什么提示可以让我完成文档编译吗？

解决方案

将以下内容添加到.Rmd文件的顶部

```{r, echo=FALSE}
knitr::opts_chunk$set(error = TRUE)
```

简单解释，RMarkdown v1 默认使用 error = TRUE，但是 RMarkdown v2 使用 error = FALSE。请查看下面 Josh 评论中的链接。

- Benjamin

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是的，它会在错误时停止运行（很明显发生在some_function(-3, 2)调用处）。您想要的结果是什么？它会打印出错误或其他内容吗？ - Josh W.

没错。我希望它显示错误信息。 - Benjamin

Answer 1

不要在RStudio中使用按钮进行编译。请尝试以下方法：

library("knitr")
knit2html("file")

- Josh W.

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很有趣。这样可以按照我想要的方式呈现文件。下一个问题是，我是否可以应用它，以便我可以将其编写为软件包中的小品文。 - Benjamin

请查看此处：http://rmarkdown.rstudio.com/authoring_migrating_from_v1.html。这只是与knitr不同的默认代码块设置。 - Josh W.

现在我感觉很傻。 我以为我已经尝试过了。 这只能意味着我已经醒太久了。 谢谢，Josh。 - Benjamin

如果您在2017年阅读此内容，则可以使用 rmarkdown::render('file.rmd', output_format = 'html_document') 进行渲染。 - Manos Parzakonis

如果您正在2019年阅读此内容，则2017年的评论仍然适用。 - user300

Answer 2

在我的情况下（2021年6月，R 4.06，最新的RStudio），替换

```{r eval=T, message=F, warning=F, error=F}

使用

```{r message=FALSE, warning=FALSE, error=FALSE}

修复了这个问题：

在 options$error && options$include 中出现无效的 'x' 类型 Calls: ... call_block -> block_exec -> in_dir -> evaluate -> `

非常奇怪....

- Pete