在R中读取具有重复行名称的CSV文件

Question

我正在尝试读取一份有重复行名的csv文件，但是无法成功。我收到的错误信息是：Error in read.table(file = file, header = header, sep = sep, quote = quote, : duplicate 'row.names' are not allowed.

我使用的代码是：

S1N657 <- read.csv("S1N657.csv",header=T,fill=T,col.names=c("dam","anim","temp"))

以下是我的数据示例：

did <- c("1N657","1N657","1N657","1N657","1N657","1N657","1N657","1N657","1N657","1N657")
aid <- c(101,102,103,104,105,106,107,108,109,110)
temp <- c(36,38,37,39,35,37,36,34,39,38)

data <- cbind(did,aid,temp)

非常感谢您的帮助。

- baz

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这个回答解决了你的问题吗？重复的'row.names'不允许错误。 - Brian D

Answer 1

该函数发现有重复的行名称，因此需要处理。可能最简单的方法是使用row.names=NULL，这将强制进行行编号--换句话说，它将您的第一列视为第一维而不是行号，因此添加行号（连续整数从“1”开始）。

read.csv("S1N657.csv", header=T,fill=T, col.names=c("dam","anim","temp"), row.names=NULL)

- doug

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太对了，道格！我看到它已经像你说的那样将我的第一列（DAM ID）作为第一维来处理了。我排除了[, -1]这一部分，然后重新命名我的列以处理多余添加的那个。非常感谢！ - baz

@Bazon，你的表头第一列没有名称。如果你给它一个名称，问题就会自动解决。 - VitoshKa

嗨道格，脚本中不应该在row.names=NULL之前加上逗号吗？这样脚本就应该是：read.csv("S1N657.csv", header=T,fill=T, col.names=c("dam","anim","temp"), row.names=NULL。 - baz

是的，谢谢——这是一个打字错误，我刚刚编辑添加了最后两个参数之间的逗号。 - doug

row.names=NULL并不能真正解决问题，它只是掩盖了问题。请建议检查标题数是否与值数匹配。 - Travis Heeter

Answer 2

试试这个：

S1N657 <- read.csv("S1N657.csv",header=T,fill=T,col.names=c("dam","anim","temp"), 
          row.names = NULL)[,-1]

- kohske

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嗨kohske，那个有效。你能解释一下代码的最后一部分：[，-1]吗？非常感谢！ - baz

嗨kohske，运行脚本后，我发现脚本中的[,-1]部分删除了行名称或我的DAM ID（DID）。 - baz

是的，你说得对。如果你需要第一列（可能是每行重复的名称），请从上面的代码中删除[,-1]。 - kohske

koshke，我从脚本中排除了[-1，]部分，因为我仍然需要我的第一列（大坝ID），并重命名列以处理创建的额外列。非常感谢！ - baz

我认为最好使用 header = TRUE 而不是直接删除第一行。 - Léo Léopold Hertz 준영

Answer 3

我最近遇到的问题是标题行中的列数与数据本身中的列数不匹配。例如，我的数据是制表符分隔的，所有数据行都有一个尾随制表符。手动添加的标题行没有。

我希望行可以自动编号，但实际上它将我的第一行视为行名。从文档中可以看出（由我强调）：

row.names-行名称的向量。这可以是给出实际行名称的向量，也可以是给出包含行名称的表格列的列号的单个数字，或者是给出包含行名称的表格列的名称的字符字符串。

如果存在标题并且第一行包含比列数少一个字段，则输入中的第一列用于行名称。否则，如果缺少row.names，则对行进行编号。

使用row.names = NULL强制进行行编号。缺少或NULL row.names生成被认为是“自动”的行名称（不被as.matrix保留）。

通过在标题行中添加一个额外的制表符，使标题行具有与数据行相同的列数，从而解决了该问题。

- imichaeldotorg

Answer 4

猜测您的csv文件是从xlsx转换而来的。在第一行末尾添加逗号，删除最后一行，完成。

- chen

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你的回答似乎没有解决所提出的问题，而且质量较低。请考虑更详细地阐述一下。 - avalancha

这实际上很有帮助...正如Travis Heeter所解释的那样，这可能是由于标题中缺少列。如果是这种情况，解决方法是在文本编辑器中打开文件，在第一行末尾添加逗号并保存。之后应该就可以找到它了。 - George Liu

Answer 5

我曾经遇到一个小CSV文件的问题，出现了“不允许重复的'row.names'”错误。问题在于，在我想要的14x14图表区域之外，有一个带有空格/其他数据的随机单元格。

当我运行“row.names = NULL”时，发现我的表格下面有多行空白数据（因此多个重复的行名称都是“空白”），找到了答案。

解决方案是删除表格区域外的所有行/列，然后问题得到解决！

- Nathan Kuhn

Answer 6

简而言之，检查你的列名。如果你的第一行是列名，那么可能会缺少一个或多个列名。

例如：

"a","b","c"
a,b,c,d
a,b,c,d

上面的例子会导致一个row.name错误，因为每一行都有4个值，但只有3列被命名。

当我从在线资源构建csv时，这种情况发生过。

- Travis Heeter

Answer 7

在我的情况下，问题来自于Excel文件。虽然它看起来完美无缺，但是它没有工作，我一直收到以下消息：Error in read.table(file = file, header = header, sep = sep, quote = quote, : duplicate 'row.names' are not allowed.

我尝试将我的Excel矩阵复制粘贴到一个新的空Excel表中，并重新尝试读取它：它成功了！不再有错误消息了！

- SkyR