我正在尝试使用python-igraph编写一个顶点聚类图形，并将其作为gexf文件保存。你有任何想法如何完成吗？我知道我可以写其他格式[http://www.cs.rhul.ac.uk/home/tamas/development/igraph/tutorial/tutorial.html#igraph-and-the-outside-world]，但我希望它是gexf格式。有一个pygexf包，但文档还不完善。
1个回答
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看起来python-igraph不支持读取gexf文件。这是Graph.Read()的文档。 Graph.Read()
但是你可以使用其他工具（比如Gephi）将gexf文件转换为igraph支持的其他格式，比如gml文件。
- DylanSu
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是的，但我不想读取gexf文件，我想要输出一个。我想知道是否可以使用另一个库来实现这一点。 - ramgo
哦，我明白了。据我所知，pygexf是唯一的选择。右侧有gexf的链接。需要使用xml引擎lxml和pygexf。而且文档非常简单。但我认为它可以满足大部分的需求。 - DylanSu
我已经安装了Pygexf，但它并不够好。也许我会尝试扩展它，但那不是我的主要关注点。我正在尝试找到是否有另一种方法。也许有Gephi编程API？ - ramgo
一个 Gephi API 可以做到这一点，而 Gephi 更专注于 Java。还有另一个支持 gexf 文件的网络平台叫做 NetworkX，它是用 Python 开发的。 - DylanSu
你可以将igraph中的内容写入到networkx中，然后再从networkx导入到Gephi中。@ramgo - B Furtado
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