改变heatmap.2图的布局。

Question

我们正在使用heatmap.2绘制图形。使用默认参数，我们可以得到以下布局/外观（见图1）。

1. 如何删除右侧的行名称/行标签，因为我们有数千个标签（见图1）？

2. 我们能否将颜色键从上到下绘制（见图2）？

- Eman

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虽然不太优雅，但将行边距设置为0可以将行标签从画布的可见部分移除：heatmap.2(..., margins=c(5,0)。 - lukeA

Answer 1

问题1：可以通过设置labRow = ""来删除行名称。

问题2：如果要添加键，则heatmap.2使用2x2表格进行布局，并将键放在左上角单元格中。您需要编辑该函数以具有2x3布局，并将键放在右下角单元格中，同时编辑显示以显示指示的内容。

- Christopher Louden

Answer 2

问题2. Ian 对heatmap.2组件的布局给出了优秀的解释。您可以更改布局（在绘制每个元素的表格中的单元格数量，例如2x2、2x3、3x2、3x3等），以及热图的每个元素的位置（即热图、行树状图、列树状图和键）。

例如：

# Define custom layout for heatmap
mylmat = rbind(c(0,3,0),c(2,1,0),c(0,4,0)) # creates 3x3 table with location of heatmap elements defined
mylwid = c(1.5,4,0.5)
mylhei = c(1.5,4,1)

# Plot your heatmap
heatmap.2(matrix.name, lmat=mylmat, lwid=mylwid, lhei=mylhei, ...)

尽管我不确定是否可以将键垂直或水平更改（据我所知！），但您可以将其放置在热图和/或树状图的任何位置。

- Keith W. Larson