无法合并节点错误：Neo4j

Question

我有2个CSV文件，想将它们转换成Neo4j数据库。它们的格式如下：

first file:

name,enzyme
Aminomonas paucivorans,M1.Apa12260I
Aminomonas paucivorans,M2.Apa12260I
Bacillus cellulosilyticus,M1.BceNI
Bacillus cellulosilyticus,M2.BceNI

second file 

name,motif
Aminomonas paucivorans,GGAGNNNNNGGC
Aminomonas paucivorans,GGAGNNNNNGGC
Bacillus cellulosilyticus,CCCNNNNNCTC

正如你所看到的，共同因素是生物名称和。每个生物将有几种酶，每种酶将有1个基序。基序可以在酶之间相同。我使用以下语句创建我的数据库：

USING PERIODIC COMMIT
LOAD CSV WITH HEADERS FROM "file:C:/Users/Desktop.n_e.csv" AS csvLine
MATCH (o:Organism { name: csvLine.name}),(e:Enzyme { name: csvLine.enzyme})
CREATE (o)-[:has_enzyme]->(e)

USING PERIODIC COMMIT
LOAD CSV WITH HEADERS FROM "file:C:/Users/Desktop/n_m.csv" AS csvLine
MATCH (o:Organism { name: csvLine.name}),(m:Motif { name: csvLine.motif})
CREATE (o)-[:has_motif]->(m) 

然而我一直收到错误信息Cannot merge node using null property value for name (Failure when processing URL 'file:C:/Users/Desktop/n_e.csv' on line 2. No rows seem to have been committed. Note that this information might not be accurate.)。我在谷歌上搜寻了这个问题，但没有一个可行的解决方案。我确保我的CSV是“普通” csv（没有空格，只有逗号分隔），但我仍然遇到这个问题。我正在使用Neo4j的2.1.3版本。任何帮助都将不胜感激。

文件1：n_e.csv 文件2：n_m.csv

- letsc

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你好letsc，我也遇到了这种错误。对我有用的解决方法是我还插入了FIELDTERMINATOR ','。希望它能解决你的问题。 - Gondil

Answer 1

1. 更新到2.1.5版本
2. 阅读这篇博客文章，了解如何检查数据是否被正确读入
3. 另外，您还需要检查是否有Windows换行符或UTF 2字节文件前缀
4. 检查是否已经建立了:Organism(name)、:Enzyme(name)和:Motif(name)的索引

总的来说，可以尝试这样做并检查输出结果：

LOAD CSV WITH HEADERS FROM "file:C:/Users/Desktop.n_e.csv" AS csvLine
RETURN csvLine
LIMIT 5

LOAD CSV WITH HEADERS FROM "file:C:/Users/Desktop.n_e.csv" AS csvLine
RETURN csvLine.name,csvLine.enzyme 
LIMIT 5

- Michael Hunger

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我尝试过了。它没有出现任何错误，但结果显示为“显示0个节点，0个关系”。我在问题中包含了我的.csv文件的链接。你可以看一下。据我所知，它们是正确的。 - letsc

Answer 2

在我的情况下，问题是标题行中的空格。例如，一个 CVS 文件：

Name, Surname, City
Jan, Kowalski, Gdansk

所以，Name 被成功导入了，但是 Surname 没有被识别（为 null）， 逗号和 Surname 之间的空格也是如此。在去除它们后，它开始正常工作。

- Waldemar Kokorzycki