如何在R语言中删除图形中的顶点？

Question

我正在尝试使用delete.vertices(graph, vertex id)在图中删除顶点，但是我看到了这个错误："Cannot create iterator, Invalid vertex id, Invalid vertex id"

这是我的代码：

graph<-read.graph(paste0("H:/graph.txt"),format="ncol",directed="TRUE")
delete.vertices(graph,c(717527,61373))

717527和61373是我的顶点编号。

这是图示：

我该怎么做？

- sahar

Answer 1

你会收到这个错误，是因为其中一个给定的顶点不在图顶点列表中。建议尝试使用igraph函数进行实践，并一旦熟悉后将其应用到自定义图形中。以下是一个示例：

 library(igraph)
 g <- graph.ring(10)
 V(g)
Vertex sequence:
 [1]  1  2  3  4  5  6  7  8  9 10

现在我正在尝试删除一个已存在的顶点:

delete.vertices(g, c(2,7,9) )
IGRAPH U--- 7 4 -- Ring graph
+ attr: name (g/c), mutual (g/x), circular (g/x)

对于不存在的内容，我会得到您的错误提示：

delete.vertices(g, c(20))

Error in delete.vertices(g, c(20)) : 
  At iterators.c:759 : Cannot create iterator, invalid vertex id, Invalid vertex id

- agstudy

Answer 2

您是否正在使用Igraph？

如果read.graph函数将顶点ID读取为字符串，则您可能需要进行以下操作：

delete.vertices(graph,c('717527','61373'))

相反，使用delete.verticies方法会返回一个新的图形对象。如果您想看到更改后的结果，请确保将结果存储在您的图形中。

graph<-read.graph(paste0("H:/graph.txt"),format="ncol",directed="TRUE")
graph<-delete.vertices(graph,c('717527','61373'))

- CrazyWhatsIt