如何在Mac Mountain Lion OS X v10.8上使用pip安装Scipy

Question

我在Mountain Lion上使用pip安装Scipy遇到了严重的困难。

我已经尝试过：

sudo pip install -e git+https://github.com/scipy/scipy#egg=scipy-dev

在网上的多个地方都提到过这一点。

这会导致出现以下错误：

ld: library not found for -lgcc
lipo: can't figure out the architecture type of: /var/tmp//ccC2HLVs.out

在错误出现之前，我假设有几个警告（我认为不是很严重）。

有人有什么建议吗？

- arlogb

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我还没有安装Mountain Lion，但根据我的经验，我建议在第一步中远离pip。下载源代码并使用python setup.py install --user自行编译。--user标志将强制在~/.local中安装，无需使用sudo。 - Pierre GM

Answer 1

现在可以通过 homebrew tap 获取 Scipy。如果您已经安装了 homebrew：

brew tap samueljohn/python
brew install scipy

在此处查看更多信息：homebrew-python

- Anton I. Sipos

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此外，我需要先使用Homebrew的Python（'brew install python; brew link --overwrite python'），然后在安装tap和scipy之后（这些都是成功的）：'pip install python-dateutil'。 - akauppi

Answer 2

Pip在OS X下安装scipy时通常会遇到困难。从源代码安装并不容易，因此我建议不要这样做。在OS X下，你有几个更好的选择：

• Scipy超级包，一堆预编译的二进制文件
• Enthought Canopy（免费或其他版本）已经包含了你需要的一切（如numpy、scipy、matplotlib等）
• Anaconda，一个免费的科学Python发行版，可能包含了你所需的所有软件包。
• MacPorts，一个全面而灵活的包管理器，可以让你安装和维护Python发行版。
• Homebrew，另一个在OS X上流行的包管理器。

- tiago

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我希望通过 pip 来控制我的环境，因为我想保持对环境的控制。我记得之前的 OS X 版本可以实现这点。但是我现在有些困惑，为什么安装开发版本（理论上应该适用于其他人）的建议对我不起作用... - arlogb

从scipy网页中可以看到： "@arlogb 还要注意，不建议使用pip和特别是easy_install，因为这些工具经常会出现标准python setup.py install无法解决的问题。" - tiago

这有点晚了，但关于通过PIP安装，只要我先安装伪可选要求，它对我来说似乎很好用。通常，我需要执行以下操作：＃首先安装numpy和PIL，以便PIP不会搞砸scipy的安装。 pip install numpy pil pip install -r requirements.txt＃包含scipy相关的PIP问题是[Github＃25]（https://github.com/pypa/pip/issues/25） - Spikes

Scipy超级包仍然相关和最新吗？ - clifgray

Answer 3

以下是我在使用虚拟环境（Mac OS X 10.9.2 Mavericks）中安装matplotlib和scipy时的解决方案：

# See George's answer above
brew update
brew upgrade
brew install gfortran 

# See http://www.scipy.org/scipylib/building/macosx.html (the link Nathan Gould posted above)
export CXX=g++-5.1
export CC=gcc-5.1
export FFLAGS=-ff2c
sudo ln -s /usr/bin/gcc /usr/bin/gcc-5.1
sudo ln -s /usr/bin/g++ /usr/bin/g++-5.1

pip install matplotlib
pip install scipy

Matplotlib 安装很快，但是 Scipy 花费了很长时间。

- Shafique Jamal

Answer 4

补充一下@Anton I. Sipos所说的。我安装了Enthought软件包，但升级时遇到了问题，因此我决定使用Homebrew进行干净的安装。不幸的是，仅进行tap和install对我来说效果不佳。因此在搜索一段时间后，我在GitHub上找到了一个问题，由samualjohn解决并为我工作：

brew remove python
rm -rf /Library/Python/2.7/site-packages # it's save to delete this!
brew install python
pip install nose
brew install numpy
brew install scipy

问题显然是在Enthought卸载指南未涵盖的site-packages冲突方面。

注意：我不得不使用pip安装matplotlib。

- rand_acs

Answer 5

我在安装scipy时也遇到了与OSX 10.9 Mavericks相似的问题。对我有用的解决方法如下：

sudo pip list

之前展示了numpy，所以我这样做：

sudo pip install --upgrade numpy

之后

brew list

我正在展示gfortran。我确保我已经拥有最新版本。

brew update
brew upgrade

但是

sudo pip install scipy 

我遇到了一个奇怪的Fortran错误，程序无法正常运行。因此，我卸载了它并重新安装了它。

sudo brew install gfortran
sudo brew uninstall gfortran

令我惊讶的是

sudo pip install scipy 

之后就可以正常工作了。

- George

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谢谢你，帮我在Mavericks上使用Homebrew安装了scipy。（我现在还保留了gfortran的安装...） - Kay

Answer 6

我尝试了所有方法：pip、macports、easy_install等，但在Mac OS El Captain上都无法正常工作。唯一成功的方法是使用brew：

$ brew install scipy

接下来，它会要求您按照以下说明操作：

$ brew link --overwrite numpy
$ mkdir -p /Users/adrieljr/Library/Python/2.7/lib/python/site-packages
$ echo 'import sys; sys.path.insert(1, "/usr/local/lib/python2.7/site-packages")' >> /Users/adrieljr/Library/Python/2.7/lib/python/site-packages/homebrew.pth

- Adriel Jr

Answer 7

最近我在虚拟环境中安装scipy时遇到了麻烦。我的问题是gfortran没有被正确识别。我使用macports sudo port install gcc48 并通过以下方式创建符号链接只使用gfortran:

sudo ln -s /opt/local/bin/gfortran-mp-4.8 /opt/local/bin/gfortran

在我的虚拟环境中，pip install scipy 顺利完成，没有任何错误。

- biophetik

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这对我有用。在OS X 10.8.5，Python 2.7中，在venv内部工作。谢谢！@biophetik - MyPreciousss

Answer 8

在Mavericks上，以下内容有效（也可能适用于其他版本）：

如果您尚未安装，请安装pip。

sudo easy_install pip

然后安装/更新 scipy。

sudo pip install scipy -U

由于某种原因，pip将scipy安装到以下位置：

/Library/Python/2.7/site-packages/

并且不会删除旧版本。

/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7//Extras/lib/python/scipy/

所以只需删除旧版本即可使其正常工作。打印版本号：

python -c "import scipy; print scipy.__version__"

- user12719

Answer 9

在Mac OS X上使用pip安装scipy是可能的！您需要正确的C和Fortran编译器来设置scipy。此页面应该会对您有所帮助：

http://www.scipy.org/scipylib/building/macosx.html

一旦你完成了这个步骤，你就应该可以使用 pip install scipy 安装。作为额外的故障排除提示，你可能需要创建一个符号链接到你的编译器，以便设置过程可以找到它。之前的帖子 @biophetik 给出了如何执行此操作的示例。另外，当我安装scipy时，我已经在我的虚拟环境中安装了numpy。我不确定它们是否有依赖关系。

- Nathan Gould