编译和分发Cython扩展程序

Question

我有一个Python包（Python 2.7），其中包括一些使用Cython编写的优化函数。我的setup.py处理纯Python文件，并且安装的包使用未经优化的纯Python函数。

我正在尝试了解为分发C扩展设置项目的最佳方法。

目前，我在扩展文件夹中有一个特定的setup.py，可以用于编译扩展：

python setup.py build_ext --inplace

但我希望包安装也能处理C扩展，可以使用单个命令：

python setup.py

我在考虑将项目中特定的setup.py与整个项目的setup.py合并。但是，为了编译扩展模块，我需要导入numpy。但我知道在setup.py中导入标准库之外的任何内容都是不被鼓励的。

对于包含简单的cython扩展模块且仅使用numpy而没有其他外部库的Python包，最佳实践是什么？

- user2304916

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但我知道在setup.py中导入标准库之外的任何内容都是不被鼓励的。你从哪里找到这个信息的？ - cel

在新的虚拟环境中安装软件包的依赖项时，它会中断安装过程。例如，请参见：https://github.com/lmfit/lmfit-py/issues/149 - user2304916

我建议看看其他项目是如何解决这个问题的，例如：https://github.com/statsmodels/statsmodels/blob/master/setup.py我不会说导入第三方模块是不鼓励的。然而，事实上你不能只写 import numpy 而不遇到麻烦。使用 try 语句进行防御性导入和使用 setuptools 的 install_requires 可能会为您解决问题。 - cel

你知道requires和install_requires之间的区别吗？ - user2304916

请参见以下链接：https://dev59.com/emMm5IYBdhLWcg3wTtfi - cel

完美的答案，谢谢！ - user2304916

Answer 1

目前，我采用了以下解决方案，需要导入numpy。到目前为止，它没有引起任何问题。

setup.py

from setuptools import setup
from setuptools.extension import Extension
import numpy as np
import versioneer

## Metadata
project_name = 'foobar'
long_description = """
Long description in RST. Used by PyPI.
"""

## Configure versioneer
versioneer.VCS = 'git'
versioneer.versionfile_source = project_name + '/_version.py'
versioneer.versionfile_build = project_name + '/_version.py'
versioneer.tag_prefix = '' # tags are like 1.2.0
versioneer.parentdir_prefix = project_name + '-'

## Configuration to build Cython extensions
try:
    from Cython.Distutils import build_ext
except ImportError:
    # cython is not installed, use the .c file
    has_cython = False
    ext_extention = '.c'
else:
    # cython is installed, use .pyx file
    has_cython = True
    ext_extention = '.pyx'
ext_modules = [Extension("corecalculation_c",
                         [project_name + \
                         "/calculation/corecalculation_c" + ext_extention])]

## Configure setup.py commands
cmdclass = versioneer.get_cmdclass()
if has_cython:
    cmdclass.update(build_ext=build_ext)


setup(name = project_name,
      version = versioneer.get_version(),
      cmdclass = cmdclass,
      include_dirs = [np.get_include()],
      ext_modules = ext_modules,
      author = 'Author Name',
      author_email = 'email@address',
      url          = 'http://github.com/USER/PROJECT/',
      download_url = 'http://github.com/USER/PROJECT/',
      install_requires = ['numpy', 'scipy', 'matplotlib', 'ipython'],
      license = 'GPLv2',
      description = ("Oneline description"),
      long_description = long_description,
      platforms = ('Windows', 'Linux', 'Mac OS X'),
      classifiers=['Intended Audience :: Science/Research',
                   'Operating System :: OS Independent',
                   'Programming Language :: Python',
                   'Programming Language :: Python :: 2.7',
                   'Topic :: Scientific/Engineering',
                   ],
      packages = [project_name, project_name+'.utils'],
      keywords = 'keyword1 keyword2',
      )

- user2304916