使用R和dplyr计算多列中的出现次数

Question

这应该是一个简单的解决方案...我只是不能理解它。我想要计算数据框中多个列的一个因子出现的次数。有13列，范围从abx.1到abx.13，并且有大量的行。

样本数据框:

library(dplyr)
 abx.1 <- c('Amoxil', 'Cipro', 'Moxiflox', 'Pip-tazo')
 start.1 <- c('2012-01-01', '2012-02-01', '2013-01-01', '2014-01-01')
 abx.2 <- c('Pip-tazo', 'Ampicillin', 'Amoxil', NA)
 start.2 <- c('2012-01-01', '2012-02-01', '2013-01-01', NA)
 abx.3 <- c('Ampicillin', 'Amoxil', NA, NA)
 start.3 <- c('2012-01-01', '2012-02-01', NA,NA)
 worksheet <-data.frame (abx.1, start.1, abx.2, start.2, abx.3, start.3)

我希望的结果：

1. 药品名 数量
2. 阿莫西林 3
3. 氨苄青霉素 2
4. 哌拉西林钠/他唑巴坦钠 2
5. 环丙沙星 1
6. 莫西沙星 1

我尝试过：

worksheet %>% group_by (abx.1, abx.2, abx.3) %>% summarise(count = n())

这并没有给我想要的输出结果。如果有任何想法，将不胜感激。

- Tom O

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你的数据无法再现。但是你可能只是在寻找 table(unlist(worksheet[grepl("abx", names(worksheet))]))。 - David Arenburg

Answer 1

如果您想使用 dplyr 解决方案，我建议先将数据转换为长格式，然后再与 tidyr 结合使用。

library(tidyr)
worksheet %>%
  select(starts_with("abx")) %>%
  gather(key, value, na.rm = TRUE) %>%
  count(value)

# Source: local data frame [5 x 2]
# 
#        value n
# 1     Amoxil 3
# 2 Ampicillin 2
# 3      Cipro 1
# 4   Moxiflox 1
# 5   Pip-tazo 2

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如果使用基本的 R 语言，则只需：

as.data.frame(table(unlist(worksheet[grep("^abx", names(worksheet))])))
#         Var1 Freq
# 1     Amoxil    3
# 2      Cipro    1
# 3   Moxiflox    1
# 4   Pip-tazo    2
# 5 Ampicillin    2

- David Arenburg