安装RMySQL时出错，错误为RS-MySQL.h:32:19: 致命错误：mysql.h：没有那个文件或目录。

Question

我尝试安装RMySQL库（R版本2.14.2，WinXP 32位系统），但是出现了以下错误信息：

install.packages("D:/R/library/RMySQL_0.9-3.tar.gz",repos=NULL, type="source")

...

RS-MySQL.h:32:19: fatal error: mysql.h: No such file or directory
compilation terminated.
make: *** [RS-MySQL.o] Error 1
ERROR: compilation failed for package 'RMySQL'
* removing 'C:/Dokumente und Einstellungen/Giordano/R/win-library/2.14/RMySQL'
Warning message:
In install.packages("D:/R/library/RMySQL_0.9-3.tar.gz", repos = NULL,  :
  installation of package 'D:/R/library/RMySQL_0.9-3.tar.gz' had non-zero exit status

这只是输出的一部分，其中包含错误信息。我不理解这个消息，也许有人可以给我一些建议。 感谢帮助。 giordano。

- giordano

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我的第一个建议是阅读有关从源代码安装此软件包的文档。仅仅浏览一下就可能找到潜在的答案。 - joran

我赞同@joran的建议，但我鼓励你仔细阅读错误信息...特别是关于“mysql.h: No such file or directory”的部分。 - Joshua Ulrich

我发布了一篇更加详细的答案，如果我想让原帖发表者学会如何钓鱼，这可能不是最佳选择 :) - Paul Hiemstra

@所有人，谢谢回复：是的，我看到了。但我不明白问题出在哪里。是的，我假设问题与mysql.h有关。但mysql.h是什么？我该如何解决这个问题？ - giordano

Answer 1

R无法找到构建软件包所需的MySQL头文件。正如文档所述：

安装MySQL二进制发行版时，您需要安装“C包含文件/库文件”。

解决方法是安装MySQL头文件。

- Paul Hiemstra

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谢谢回复。那么，我需要重新安装MySQL吗？还是有其他方法可以获取这个库，如果有的话，在哪里安装？奇怪的是，我使用MySQL/R已经很多年了，从来没有问题。自从我最近安装了新版本的R以来，我就遇到了这个问题。所以，旧版本的R/RMySQL是否可以在没有MySQL.h的情况下工作，而新版本则需要这个头文件？这真的很令人困惑。 - giordano

仔细阅读文档，我认为你正在寻找的信息应该在那里。我没有在Windows下使用mysql的经验，所以我很难给出比阅读手册更好的建议。 - Paul Hiemstra

Answer 2

以下是安装mysql头文件库的一些指针：

https://github.com/jeffreyhorner/RMySQL

(该站点现在已经移动到这里)

http://biostat.mc.vanderbilt.edu/wiki/Main/RMySQL

关键是要在R\etc文件夹中拥有Renviron.site文件，并且在从源代码编译之前将libmysql.dll放置在正确的位置。

祝你好运。

- user1480926

Answer 3

你永远无法在Windows上获得RMySQL的预编译二进制包，因为在安装之前它会检查MySQL路径和其他包含文件的有效性。

- Sagar Nikam

Answer 4

我遇到了同样的问题。后来我发现安装程序将临时文件放在默认的工作目录中，而我已经在Rprofile.site文件中编辑过该目录。当它随后尝试使用这些文件（包括mysql.h）时，就找不到它们了。当我将Rprofile.site文件恢复为默认设置时，一切都正常了。希望这个方法能有所帮助，如果其他方法都没用的话。

- Josh Morel