Segmentation fault 后空的核心转储文件

Question

我正在运行一个程序，但是它被 Segmentation fault 中断了。问题在于，虽然创建了核心转储文件，但大小为零。

你听说过这种情况吗？怎么解决呢？

我的磁盘上有足够的空间。我已经执行了 ulimit -c unlimited 来取消限制核心转储文件大小，无论是在运行时还是将其放置在提交的批处理文件的顶部，但仍然只有 0 字节的核心转储文件。包含这些文件的文件夹的权限为 uog+rw，创建的核心文件的权限仅为 u+rw。

该程序是用 C++ 编写的，并使用 Grid Engine 的 qsub 命令在 Linux 集群上提交的。我不知道这些信息是否与此问题相关。

- Ali

---

你的硬盘上有足够的空间吗？ - Mark Loeser

下一个问题：包含目录的权限是什么？进程是否在与目录所有者不同的有效用户ID下运行？ - eh9

你说你正在使用Grid Engine。群集中是否有多个节点是正确的？多个节点很容易共享单个文件系统，但如果它们不共享用户帐户系统，则在另一个节点上运行的作业可能无法在您自己的用户ID下运行作业，因此将文件系统视为“其他” ID。 - eh9

尝试创建一个临时目录，并将其权限设置为全局可写。 - eh9

我已经没有想法了。此外，我建议将一些信息添加到问题中，以便我们可以清理这些评论。 - eh9

Answer 1

开启 ulimit -c unlimited 设置后，生成了核心转储文件。 默认情况下，核心转储文件生成在当前目录上，该目录位于nfs上。 将 /proc/sys/kernel/core_pattern 设置为 /tmp/core 帮助我解决了空转储文件的问题。

Ranjith Ruban 的评论 帮助我开发了这个解决方法。

您用于转储核心的文件系统是什么？

- Yuri Pozniak

---

我在一台安装了Linux的VirtualBox虚拟机上遇到了问题，这台虚拟机使用vboxsf文件系统映射到了主机机器的NTFS驱动器。 - Mike Tunnicliffe

以root用户身份修改core_pattern有神奇的效果！NFS驱动器路径使core文件大小为零字节。https://dev59.com/Zmcs5IYBdhLWcg3wjUqR#12760552 此外，除了设置创建路径外，还有一些巧妙的语法可以更改核心文件的命名方式。http://www.linuxhowtos.org/Tips%20and%20Tricks/coredump.htm - phyatt

在VirtualBox下挂载文件系统时遇到了同样的问题。谢谢！ - Daniel

Answer 2

似乎您正在使用批处理调度程序来启动可执行文件。也许Torque/PBS使用的shell在派生作业时继承了不同的ulimit值？或者调度程序的默认配置不是保留核心转储文件？

您可以直接从命令行运行程序吗？

如果在调用可执行文件之前在PBS批处理脚本的顶部添加和/或，则可以覆盖PBS的默认ulimit行为。或者添加'ulimit -c'可以报告限制是什么。

- Randy

---

我在PBS批处理脚本中加入了ulimit -c unlimited和ulimit -s unlimited，但是核心转储文件仍然为空！ - Ali

你使用的文件系统用于转储核心是什么？ - Ranjith Ruban

Answer 3

如果您在挂载的驱动器上运行核心文件，则无法将核心文件写入挂载的驱动器，而必须写入本地驱动器。

您可以将文件复制到本地驱动器。

- gglinux

Answer 4

您可以使用qsub选项，例如-l h_vmem=6G来设置所需的物理内存等资源限制，以保留6 GB的物理内存。

对于文件块，您也可以设置适当的h_fsize值。

请参阅qconf手册中的RESOURCE LIMITS部分：

http://gridscheduler.sourceforge.net/htmlman/htmlman5/queue_conf.html

s_cpu     The per-process CPU time limit in seconds.

s_core    The per-process maximum core file size in bytes.

s_data    The per-process maximum memory limit in bytes.

s_vmem    The same as s_data (if both are set the minimum is
           used).
h_cpu     The per-job CPU time limit in seconds.

h_data    The per-job maximum memory limit in bytes.

h_vmem    The same as h_data (if both are set the minimum is
           used).

h_fsize   The total number of disk blocks that this job  can
           create.

此外，如果集群在每个节点上使用本地TMPDIR，并且该目录正在填满，您可以将TMPDIR设置为具有更大容量的备用位置，例如NFS共享：

export TEMPDIR=<some NFS mounted directory>

然后使用-V选项启动qsub，将当前环境导出到作业中。

以上的一种或多种组合可能会帮助您解决问题。

- Vince