SunGridEngine、Condor和Torque作为PVM的资源管理器

Question

SunGridEngine、Condor和Torque作为PVM的资源管理器

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有没有人知道哪个资源管理器适合PVM？或者我不应该使用PVM，而是依赖于MPI（或任何版本，例如MPICH-2 [还有其他更好的版本吗]）。使用PVM的主要原因是之前开始这个项目的人假定了使用PVM。然而，现在这个项目是我的（他没有做任何依赖于PVM的重要工作），这可以很容易地改变，最好是安装容易的东西，因为安装和设置PVM很麻烦。

我倾向于SunGridEngine，因为我有专用的硬件，在阅读另一篇文章后，它似乎是更适合专用硬件的胜者。但是我不确定它在使用PVM时的性能。想知道是否有人有使用PVM和SGE的经验？

如果人们使用SGE，您会使用什么来从计算机到计算机（或虚拟机到虚拟机）进行通信？

哦，如果这很重要，我将运行Perl应用程序/行。

有什么建议或想法吗？

感谢所有评论的提前致意，

Tyug

- Tyug

1个回答

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可以查看英文原文，
原文链接

- Pete · Accepted Answer

我在Linux系统上使用Torque、SGE和LSF运行PVM没有遇到任何问题。你是否在问“是否可以使用SGE、Torque等来运行PVM应用程序？”

如果是这样，可以查看下面我提供的Linux c-shell作业脚本示例。请注意，这些脚本几乎相同，只有每个脚本的头部不同，符合各自资源管理器的适当格式。

SGE作业脚本：

#!/bin/csh
#$ -N LTR-001
#$ -o LTR-001.output
#$ -e LTR-001.error
#$ -pe comp 24
#$ -l h_rt=04:00:00
#$ -A cmit2
#$ -cwd
#$ -V

# Setup envirnoment
setenv LD_LIBRARY_PATH /lfs0/projects/cmit2/opt-intel/overture-noX/lib:${LD_LIBRARY_PATH}
setenv PVM_ARCH LINUX
setenv PVM_ROOT /lfs0/projects/cmit2/opt-intel/pvm3
setenv PVM_BIN ${PVM_ROOT}/bin
setenv PVM_RSH /usr/bin/ssh
setenv MY_HOSTS pvm_hostfile

rm -f ~/.pvmprofile
env | grep PVM_ > ~/.pvmprofile

# Create file containing _unique_ host names.  Note that there are two possible sources of available hosts
sort -k 1,1 -u ${MACHINE_FILE} >! ${MY_HOSTS}

# Start PVM & add nodes
printf "%s\n%s\n" conf quit|${PVM_ROOT}/lib/pvm ${MY_HOSTS}
wait
sleep 2

#
# Run apps requiring PVM.
#

wait
# Exit PVM daemon
echo "reset" | $PVM_ROOT/lib/pvm
echo "halt" | $PVM_ROOT/lib/pvm

扭矩作业脚本：

#!/bin/csh
#PBS -N LTR-001
#PBS -o LTR-001.output
#PBS -e LTR-001.error
#PBS -l nodes=3:ppn=8
#PBS -l walltime=04:00:00
#PBS -q compute
#PBS -d .

# Setup envirnoment
setenv LD_LIBRARY_PATH /users/ps14/opt-intel/overture/lib:${LD_LIBRARY_PATH}
setenv PVM_ARCH LINUX64
setenv PVM_ROOT /users/ps14/opt-intel/pvm3
setenv PVM_BIN ${PVM_ROOT}/bin
setenv PVM_RSH ${PVM_ROOT}/ssh
setenv MY_HOSTS pvm_hostfile

rm -f ~/.pvmprofile
env | grep PVM_ > ~/.pvmprofile

# Create file containing _unique_ host names.  Note that there are two possible sources of available hosts
sort -k 1,1 -u ${PBS_NODEFILE} >! ${MY_HOSTS}

# Start PVM & add nodes
printf "%s\n%s\n" conf quit|${PVM_ROOT}/lib/pvm ${MY_HOSTS}
wait
sleep 2

#
# Run apps requiring PVM.
#

wait
# Exit PVM daemon
echo "reset" | $PVM_ROOT/lib/pvm
echo "halt" | $PVM_ROOT/lib/pvm