在R中，我能否将已加载的包与工作区一起保存？

Question

R通常只会将对象保存在.GlobalEnv中：

$ R
> library(rjson)
> fromJSON
function (...) ...
> q(save='yes')
$ R
> fromJSON
Error: object 'fromJSON' not found

有没有办法也保存这些信息？

- Owen

Answer 1

现在您可以将R会话信息保存到文件中并在另一个会话中加载它。

首先安装“session”软件包：

install.packages('session')

加载您的库和数据，然后将会话状态保存到文件中：

library(session)
library(ggplot2) # plotting

test <- 100

save.session(file='test.Rda')

然后，在另一个会话中可以加载会话状态：

library(session)

restore.session(file='test.Rda')

#ggplot2 (and associated data) should have loaded with the session data
head(diamonds)
ggplot(data = diamonds, aes(x = carat)) +
  geom_histogram()

print(test)

参考资料: https://www.rdocumentation.org/packages/session/versions/1.0.3/topics/save.session

这是一个关于保存R session的函数。在数据分析中，经常需要保存当前的session，以便下次恢复工作环境。 该函数可以将session保存到指定的文件路径中，并在需要时重新载入所保存的session。

- ConnectedSystems

Answer 2

据我所知，不行。工作空间是用于数据和函数等对象的。启动R并加载特定包是您的.Rprofile文件的作用，您可以在每个目录中拥有不同的文件。

您可以将加载所需包的函数保存在工作空间中，然后在首次启动R时运行该函数。

- joran

Answer 3

您可以使用检查点程序，例如DMTCP来保存整个R进程并在以后重新启动它。

- Owen

Answer 4

我建议不要在r会话之间保存任何东西，而是使用代码重新创建所有内容。这样更有可能产生可重复的结果。

- hadley

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没错，我总是尽力把所有东西都编成可以直接运行的代码，只不过当脚本变得越来越长时，重复运行它们会变得很慢。 - Owen

还要注意包的包含顺序，因为其中一个对象可能会掩盖另一个对象。 - smci