无法通过pip安装Scipy

Question

通过pip安装scipy时，使用以下命令：

pip install scipy

Pip在构建scipy时失败，并抛出以下错误：

Cleaning up...
Command /Users/administrator/dev/KaggleAux/env/bin/python2.7 -c "import setuptools, tokenize;__file__='/Users/administrator/dev/KaggleAux/env/build/scipy/setup.py';exec(compile(getattr(tokenize, 'open', open)(__file__).read().replace('\r\n', '\n'), __file__, 'exec'))" install --record /var/folders/zl/7698ng4d4nxd49q1845jd9340000gn/T/pip-eO8gua-record/install-record.txt --single-version-externally-managed --compile --install-headers /Users/administrator/dev/KaggleAux/env/bin/../include/site/python2.7 failed with error code 1 in /Users/administrator/dev/KaggleAux/env/build/scipy
Storing debug log for failure in /Users/administrator/.pip/pip.log

我该如何让scipy成功构建？自从我升级到OSX Yosemite后，这可能是一个新问题，因为以前安装scipy没有遇到过问题。

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调试日志:

Cleaning up...
  Removing temporary dir /Users/administrator/dev/KaggleAux/env/build...
Command /Users/administrator/dev/KaggleAux/env/bin/python2.7 -c "import setuptools, tokenize;__file__='/Users/administrator/dev/KaggleAux/env/build/scipy/setup.py';exec(compile(getattr(tokenize, 'open', open)(__file__).read().replace('\r\n', '\n'), __file__, 'exec'))" install --record /var/folders/zl/7698ng4d4nxd49q1845jd9340000gn/T/pip-eO8gua-record/install-record.txt --single-version-externally-managed --compile --install-headers /Users/administrator/dev/KaggleAux/env/bin/../include/site/python2.7 failed with error code 1 in /Users/administrator/dev/KaggleAux/env/build/scipy
Exception information:
Traceback (most recent call last):
  File "/Users/administrator/dev/KaggleAux/env/lib/python2.7/site-packages/pip/basecommand.py", line 122, in main
    status = self.run(options, args)
  File "/Users/administrator/dev/KaggleAux/env/lib/python2.7/site-packages/pip/commands/install.py", line 283, in run
    requirement_set.install(install_options, global_options, root=options.root_path)
  File "/Users/administrator/dev/KaggleAux/env/lib/python2.7/site-packages/pip/req.py", line 1435, in install
    requirement.install(install_options, global_options, *args, **kwargs)
  File "/Users/administrator/dev/KaggleAux/env/lib/python2.7/site-packages/pip/req.py", line 706, in install
    cwd=self.source_dir, filter_stdout=self._filter_install, show_stdout=False)
  File "/Users/administrator/dev/KaggleAux/env/lib/python2.7/site-packages/pip/util.py", line 697, in call_subprocess
    % (command_desc, proc.returncode, cwd))
InstallationError: Command /Users/administrator/dev/KaggleAux/env/bin/python2.7 -c "import setuptools, tokenize;__file__='/Users/administrator/dev/KaggleAux/env/build/scipy/setup.py';exec(compile(getattr(tokenize, 'open', open)(__file__).read().replace('\r\n', '\n'), __file__, 'exec'))" install --record /var/folders/zl/7698ng4d4nxd49q1845jd9340000gn/T/pip-eO8gua-record/install-record.txt --single-version-externally-managed --compile --install-headers /Users/administrator/dev/KaggleAux/env/bin/../include/site/python2.7 failed with error code 1 in /Users/administrator/dev/KaggleAux/env/build/scipy

- agconti

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尝试使用“sudo pip install scipy”。 - Piotr Dabkowski

@PiotrDabkowski 我通过homebrew安装了python，所以不应该需要使用sudo。此外，在构建步骤中为什么要使用sudo呢？如果它抛出权限被拒绝或者其他问题，我才能考虑使用sudo。 - agconti

你确定错误不是由于某些权限问题引起的吗？ - Piotr Dabkowski

Windows用户可以在这里查看我的答案：https://dev59.com/5XI_5IYBdhLWcg3wHvQ5#40275240 - Statham

对于Centos，请确保您安装了lapack-devel，如果没有，请执行yum install lapack-devel。 - Divyank Shukla

Answer 1

在向SciPy团队提出问题后，我们发现你需要使用以下命令升级pip：

pip install --upgrade pip

在Python 3中，这个代码是有效的：

python3 -m pip install --upgrade pip

为了让 SciPy 正确安装，需要满足以下条件：

较旧的 pip 版本需要使用 --use-wheel 参数指定使用 wheels。或者您可以升级 pip，然后它应该可以自动识别并使用 wheels。

升级 pip 可以解决该问题，但您也可以尝试直接使用 --use-wheel 参数。

- agconti

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这对我来说有效，但我还需要安装Luke建议的软件包 sudo apt-get install libatlas-base-dev gfortran。 - BenB

我必须在升级之前删除旧版本的pip。然后它就完美地工作了。 - Autonomous

此外，在我全新的14.04安装中，我还必须执行 sudo apt-get install python-dev。 - BenB

在安装过程中，我遇到了很多 pip 包错误。升级 pip 解决了所有的错误。 - burhan rashid

Answer 2

对于使用 64 位 Python 安装程序的 Microsoft Windows 用户，需要从这里下载 Scipy 的 64 位 .whl 文件，然后只需cd 到您下载了 .whl 文件的文件夹并运行：

pip install scipy-0.16.1-cp27-none-win_amd64.whl

- Conor

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scipy-0.16.1-cp27-none-win_amd64.whl 不支持此平台。 - Watchmaker

或许您已经尝试过这个方法，但是要确保在cp后面的数字与您的Python版本匹配（例如，cp34 = 3.4），而且amd64/win32也要正确。 - fdsa

D:\TEMP>pip install "scipy-0.19.1-cp35-cp35m-win_amd64.whl" 要求的 'scipy\u20110.19.1\u2011cp35\u2011cp35m\u2011win_amd64.whl' 看起来像是一个文件名，但该文件不存在。 scipy\u20110.19.1\u2011cp35\u2011cp35m\u2011win_amd64.whl 不是有效的 wheel 文件名。D:\TEMP>pip install "test.whl" test.whl 不是有效的 wheel 文件名。D:\TEMP>pip install test.whl test.whl 不是有效的 wheel 文件名。 我进入目录尝试运行它，然后出现错误。然后我更改文件名尝试运行它，又出现了另一个错误。这种方法不起作用... - user32882

我和@user32882遇到了同样的问题，我们做错了什么？ - gen

@gugol 我也遇到了同样的问题，@Cyclotron3x3 的注释帮了我很大的忙；文件名中的“-cp27”指的是Python的版本，我必须找到文件名中带有“-cp36”的文件来匹配我的Python版本：3.6。 - Benson

Answer 3

我在Ubuntu下安装Scipy时遇到了相同的问题。
我不得不使用以下命令：

$ sudo apt-get install libatlas-base-dev gfortran
$ sudo pip3 install scipy

您可以在这里获取更多详细信息：使用pip安装SciPy
对不起，我不知道如何在OS X Yosemite下执行此操作。

- Xin Cheng

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这解决了我在“Bash on Ubuntu on Windows 10”中遇到的问题。 - Coxy

Answer 4

在Windows 10中，大多数选项都不会起作用。按照以下步骤操作：

在Windows 10中使用CMD时，您无法直接使用大多数众所周知的命令（如wget、克隆scipy github、pip install scipy等）下载scipy。

要安装，请转到pythonlibs .whl文件，如果您使用的是python 2.7 32位，则下载numpy-1.11.2rc1+mkl-cp27-cp27m-win32.whl和scipy-0.18.1-cp27-cp27m-win32.whl，如果使用python 2.7 64位，则下载numpy-1.11.2rc1+mkl-cp27-cp27m-win_amd64.whl和scipy-0.18.1-cp27-cp27m-win_amd64.whl。

下载后，将文件保存在您的python目录下，例如我的是c:\>python27。

然后运行：

pip install C:\Python27\numpy-1.11.2rc1+mkl-cp27-cp27m-win32.whl 
pip install C:\Python27\scipy-0.18.1-cp27-cp27m-win32.whl

注意:

1. scipy 需要依赖 numpy，因此我们在下载 scipy 之前需要下载 numpy。
2. .whl 文件中的 cp27 表示这些文件适用于 python 2.7，而 cp33 则表示适用于 python 3.x，具体来说是 >=3.3。

- Cyclotron3x3

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这对我在Windows 10上使用Python 3.5和64位机器有效。 pip install numpy-1.13.1+mkl-cp35-cp35m-win_amd64.whl pip install numpy-1.13.1+mkl-cp35-cp35m-win_amd64.whl - vlad

这个答案解决了我的问题（Windows 8.1），但我还需要下载并安装numpy+mkl wheel。如果你在按照这个答案后尝试导入scipy时出现ImportError“NUMPY_MKL”，请执行此操作。感谢@VMAtm。 - Renato Byrro

对于在Windows 10上使用的Python 3.6.2，请使用scipy-0.19.1-cp36-cp36m-win_amd64.whl。 - Dmitry

谢谢！为了使用imread，我需要安装Pillow --pip install Pillow - limitless

对于较新的版本，您需要在安装Scipy之前先安装numpy和mkl。 - Pleastry

Answer 5

在寻找这个答案以获得一些线索后，我通过执行以下操作使其正常工作

brew install gcc 
pip install scipy

这些步骤中的第一个在我2011年的Mac Book Air上花了96分钟，所以希望您不要着急！

- Liz Rice

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我实际上无法通过brew install gcc安装gcc。它最终抛出了一堆错误。但是在与Scipy团队合作后，我找到了解决方案。感谢您的答案！ - agconti

这对我来说实际上是一个简单明了的解决方案。最终没有构建和安装下载的scipy kit。 :) - Sean

这对我有用，而且第一步只花了几秒钟。 - André Fratelli

Answer 6

如果你完全是新手，可以按步骤阅读或直接跳到最后一步。按照以下方法在 Windows 64 位、Python 64 位上安装 scipy 0.18.1。如果以下命令不起作用，请继续进行。

pip install scipy

请注意这些版本的区别：

1. Python

2. Windows

3. .whl version of numpy and scipy files

4. First install numpy and scipy.

   pip install FileName.whl
   

5. For Numpy:http://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/#numpy For Scipy:http://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/#scipy

请注意文件名称（检查版本号）。

例如：scipy-0.18.1-cp35-cp35m-win_amd64.whl

要检查 pip 支持哪个版本，请参阅下面的第 2 点。

如果您正在使用 .whl 文件，则可能会出现以下错误：

您正在使用 pip 版本 7.1.0，但版本 8.1.2 可用。

您应该考虑通过命令 'python -m pip install --upgrade pip' 进行升级。

以上错误的解决方法：启动 Python 并键入：

import pip
print(pip.pep425tags.get_supported())

输出：

[('cp35', 'cp35m', 'win_amd64'), ('cp35', 'none', 'win_amd64'), ('py3', 'none', 'win_amd64'), ('cp35', 'none', 'any'), ('cp3', 'none', 'any'), ('py35', 'none', 'any'), ('py3', 'none', 'any'), ('py34', 'none', 'any'), ('py33', 'none', 'any'), ('py32', 'none', 'any'), ('py31', 'none', 'any'), ('py30', 'none', 'any')]

在输出中，您会看到cp35，因此请下载cp35用于numpy和scipy。欢迎进行进一步的编辑。

- Arun Naudiyal

Answer 7

针对Windows 10

• 从http://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/#scipy下载适用于对应python版本的whl文件

• 将其放置在目录下，运行以下命令

C:\directory> pip install scipy-0.19.0rc2-cp35-cp35m-win_amd64.whl

- Ayudh Hande

Answer 8

我更喜欢使用Conda这种更快捷的方式，而不是下载特定软件包的较难方法。pip存在其问题。

• Python版本 -v (3.6.0)
• Windows 10 (64位)

安装Conda，请从以下链接下载：https://conda.io/docs/install/quick.html#windows-miniconda-install

命令提示符

C:\Users\xyz>conda install -c anaconda scipy=0.18.1
Fetching package metadata .............
Solving package specifications:

安装于C:\Users\xyz\Miniconda3环境的软件包计划：

以下是将要安装的新软件包：

mkl:       2017.0.1-0         anaconda
numpy:     1.12.0-py36_0      anaconda
scipy:     0.18.1-np112py36_1 anaconda

以下软件包将被更高优先级的频道所取代：

conda:     4.3.11-py36_0               --> 4.3.11-py36_0 anaconda
conda-env: 2.6.0-0                     --> 2.6.0-0       anaconda

请继续（输入[y]）？ y

conda-env-2.6. 100% |###############################| Time: 0:00:00  32.92 kB/s
mkl-2017.0.1-0 100% |###############################| Time: 0:00:24   5.45 MB/s
numpy-1.12.0-p 100% |###############################| Time: 0:00:00   5.09 MB/s
scipy-0.18.1-n 100% |###############################| Time: 0:00:02   5.59 MB/s
conda-4.3.11-p 100% |###############################| Time: 0:00:00   4.70 MB/s

- Sandeep Anand

Answer 9

这是pip的替代方案。 当使用pip安装scipy时，我也遇到了同样的错误。

然后我下载并安装了MiniConda。接下来我使用以下命令安装了pytables。

conda install -c conda-forge scipy

请参考下面的截图。

- Tharindu Kumara

Answer 10

1. 从http://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/#scipy下载 SciPy。
2. 进入下载文件所在的目录，使用pip install安装文件。
3. 进入 Python shell，运行import scipy；我成功地运行了它，没有出现错误。

- Box and Cox