将R Markdown样式文件（.Rmd）用作Pweave的输入

Question

我正在尝试通过Pweave运行基本的R Markdown文档（在代码块中调用Python）。在Pweave文档中指出，您可以使用样式```{python}声明代码块。但是，当我尝试编译例如pweave -f pandoc FIR_design.mdw时，这些块没有运行，而是以逐字方式放置。 文档中的所有示例都使用noweb语法，例如：

<<fig = True, width = '12 cm', echo = False>>=
from pylab import *
plot(arange(10))
show()
@

Markdown 的等效语法为：

```{python, fig = True, width = '12 cm', echo = False}
from pylab import *
plot(arange(10))
show()
```

当我尝试使用Markdown语法运行示例时，它只是直接添加它们，而不运行代码块。这是预期的吗？如果是，我应该如何将我的.Rmd文档转换为可在Pweave中运行的文档？必须将它们转换为noweb风格吗？

这是文档示例FIR_design.mdw以.Rmd格式重写的版本（用于示例）：

• FIR_design.Rmd

- James Owers

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现在noweb风格是否有效？ - Tom Myddeltyn

是的，它可以。这个例子中的 .mdw 文件在 pweave -f pandoc FIR_design.mdw 命令下运行良好。我对下面的解决方案进行了编辑，解决了问题。给定一个 .Rmd 文件，请使用 pweave -i markdown <source>.Rmd 命令。 - James Owers

Answer 1

不要使用pweave -f pandoc <source>，请尝试使用pweave -i markdown <source>。

如果您没有提供输入格式，则会从文件扩展名中推断。如链接的源代码所示，您的输入文件需要具有.md扩展名，以便被自动检测为“Pandoc markdown”格式。

默认输出格式似乎与输入格式相同，或者使用--format (-f)提供。

- tutuDajuju