如何在knitr绘图中禁用透明度？

Question

我有一个LaTeX/knitr文档需要转换为PDF/A格式，但是出现了关于使用透明度的错误（PDF/A不允许使用透明度）。经过追踪，我发现这是由于我通过knitr在R中生成的盒形图的背景填充引起的。无论我使用"pdf"、 "cairo_pdf"或"tikzDevice"作为输出设备，都会出现相同的错误。

Tikz输出包括以下内容：

\definecolor{fillColor}{RGB}{255,255,255}
\path[use as bounding box,fill=fillColor,fill opacity=0.00] (0,0) rectangle (505.89,325.21);

手动删除fill opacity=0.00这部分并重新运行pdflatex可以消除特定图形的信息，因此我相信这就是原因。然而，我更希望在源文件（R代码）中进行更改，这样每次源文件更改并重新生成中间文件时，我就不必手动进行修复。

有人知道如何在R中传递一个神奇选项来将bxp或par转换为1.0的不透明度，或者更好的是指定没有填充吗？（考虑到它是放置在页面空白部分上的白色背景，填充是完全不必要的。）

（顺便说一句，我尝试在bxp调用中使用bg=NA和在之前使用par(bg=NA)，但两者都没有任何作用。同样地，使用"red"也没有效果，所以那似乎不是正确的选项。）

- big_m

Answer 1

显然，图形参数（par=）中的bg仅适用于绘图中的对象（如箱线图中的方框）。整个图的背景是由knitr的dev.args块选项设置的，例如全局设置：

opts_chunk$set(dev='tikz', dev.args=list(bg="white"))

在特定块的开头或者特定块的前面，填充选项好像无法被删除（在tikzDevice源代码中有一个“TODO”项），但将其更改为“white”可以消除PDF/A验证错误，并且不会对文档造成可见影响。等我的论文提交完之后，也许我可以为此提交一个补丁。 :-)

- big_m