如何将外部文件中的 R 代码片段包含到 Quarto 文档中

Question

想知道如何将外部文件中的r片段代码包含到quarto文档中。

1. 以下代码使用 knitr::read_chunk() 可以正常工作，但是需要依赖 knitr。

   knitr::read_chunk("Ch02.R")
   

2. 以下代码使用 quarto 代码可以运行而不出现任何错误，但是结果与预期不符。

   #| eval: true
   #| output: false
   #| file: Ch02.R
   

想知道在quarto中是否有任何替代knitr :: read_chunk()的方法。

- MYaseen208

Answer 1

选项1：包含

如果您想要包含其他代码片段，使用包含时只能使用 qmd 文件：

计算包含仅在 .qmd 文件中工作

让我们创建一个名为create_dataframe.qmd的简单 qmd 文件，它将向 mtcars 添加一列：

---
title: "Create dataframe"
---

```{r}
# Create data file 
mtcars$new_col = sample(c(0,1), nrow(mtcars), replace = TRUE)
```

现在你可以像这样在你的 main.qmd 文件中包含那个文件：

---
title: "Document"
---

{{< include create_dataframe.qmd >}}

Let's check if extra columns is created:

```{r}
# View dataframe
head(mtcars)
```

输出：

正如您所看到的，create_dataframe.qmd 文件中创建的列现在已经在您的主文件中了。

---

选项2：分块文件

您也可以在代码块中使用file选项。您必须确保使用eval来评估代码，就像这样：

---
title: "Document"
---

Let's check if extra columns is created:

```{r}
#| echo: true
#| eval: true 
#| file: create_dataframe.R
```

```{r}
# View dataframe
head(mtcars)
```

输出：

正如您所看到的，新列也在数据框中。

- Quinten

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谢谢您的帮助。从您的回答中我了解到，knitr::read_chunk("Ch02.R")只是将外部文件中的R代码片段包含到 Quarto 文档中的一种解决方案。 - MYaseen208

嗨@MYaseen208，请查看我的编辑答案，另有一种选择！ - Quinten

Answer 2

您可以使用source来运行有效的R代码，也可以使用file将脚本作为块包含并进行评估。

---
title: "Untitled"
format: html
---

## Include will interpret the content as markdown:

{{< include Chu1.R >}}


## Source will evaluate:

```{r}
#| echo: false
source("Chu1.R")
```


##  file will echo and evaluate

```{r,file = "Chu1.R"}

```

- user12256545

Answer 3

你可以使用 include 指令。

例如，

{{< include Ch02.R >}}

更多细节请参见https://quarto.org/docs/authoring/includes.html

- Raniere Silva