scipy：在哪里找到scipy.special.betainc的源代码？

Question

我正在尝试深入理解 stats.pearsonr 的内部机制。我想将 r, p = stats.pearsonr(x, y) 写成独立的代码（见下文）。我已经成功复制了 r 的计算过程，但是 p 值的计算需要使用 scipy.special.betainc。我在 https://github.com/scipy/scipy/tree/master/scipy/special 中查找，但并未找到 betainc （我猜测它可能是一些底层的 C 代码）。请问您知道在哪里可以找到该函数的源代码吗？

import numpy as np

x = np.random.rand(100)
y = np.random.rand(100)

n = len(x)
mx = x.mean()
my = y.mean()
xm, ym = x - mx, y - my
r_num = np.add.reduce(xm * ym)
r_den = np.sqrt(np.sum(xm*xm, 0) * np.sum(ym*ym, 0))
r = r_num / r_den
r = max(min(r, 1.0), -1.0)

df = n - 2
if abs(r) == 1.0:
    p = 0.0
else:
    t_squared = r**2 * (df / ((1.0 - r) * (1.0 + r)))
    # Now code https://github.com/scipy/scipy/blob/14142ff70d84a6ce74044a27919c850e893648f7/scipy/stats/stats.py#L3020
    _x = df/(df+t_squared)
    _x = np.asarray(_x)
    _x = np.where(_x < 1.0, _x, 1.0)
    _a = 0.5*df
    _b = 0.5
    # Code special.betainc(_a, _b, _x)

- Ray Bell

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也许这可以帮助：https://docs.scipy.org/doc/scipy-0.15.1/reference/generated/scipy.special.betainc.html - David

Answer 1

scipy.special.betainc基于scipy/special/cephes/incbet.c中的incbet函数，该函数来自Cephes Math Library。

我通过在SciPy Github存储库中搜索betainc并跟随链接找到了这个信息，这引导我到scipy/special/functions.json，然后找到了incbet。

- user2357112