能否在R脚本中运行CDO？

Question

我正在处理netcdf文件，使用CDO和R进行分析。我想知道是否可以在同一脚本中直接从R"调用"CDO。我不确定如何做到这一点（我一直在尝试使用System()来调用命令，但是我不能成功）。有人有关于这个问题的想法吗？是否可能？提前致谢。

- user3231352

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你看过这个包吗？ - J_F

是的，实际上看起来很不错，但是有一些 CDO 可以实现的功能在那个软件包中找不到。这就是为什么我想知道是否可以在 R 中运行 CDO。 - user3231352

system 函数允许您从 R 中运行几乎任何东西。问题是 <anything> 是否可以互操作。 - IRTFM

Answer 1

自2018年起，有一个名为“ClimateOperators”的R包，可以让您直接在R中使用CDO和NCO操作符，而无需使用系统命令。这是一个指向github存储库的链接： https://github.com/markpayneatwork/ClimateOperators。

- ClimateUnboxed

Answer 2

是的，使用system()函数，您可以在Linux中使用bash以及R常规例程。

例如，一个简单的代码可以将GRIB2文件转换为NetCDF。

file_grb2 = "001.grb2"
file_ncdf ="001.nc"
system(paste("cd ~/DATA/prate; cdo -f nc copy ",file_grb2,file_ncdf,sep=(" ")))

- Forever