你在使用R编程时采用了哪些最佳实践？

Question

编写 R 程序的一些好的实践方法是什么？

由于 R 是一种我不经常使用的特定目的语言，我通常只是匆忙地拼凑一些快速脚本来完成我的需求。

但是，有哪些编写干净高效的 R 代码的技巧呢？

- Frank

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一个相关的感兴趣的问题：https://dev59.com/bHM_5IYBdhLWcg3wn0vT（SO 真的应该更好地找到这些问题，它显示 jQuery 和 Windows 7 的问题为“相关”）。 - Frank

Answer 1

您已经通过表述您的方法是“快速脚本解决方案”向我们提供了一些提示。如果您想要最佳实践和结构，请简单地按照CRAN的既定最佳实践：

• 创建一个包，这将为您打开运行R CMD check的大门，这非常有用。
• 正如许多人所说，拥有一个包在代码编写阶段也有所帮助，因为您被迫记录代码；这是一件好事（TM）。
• 一旦您有了一个包，在文档的\examples{}部分中添加代码，因为这将在R CMD check期间运行，并为回归测试提供了一个简单的入口。
• 一旦您熟悉了回归测试，请开始使用像RUnit这样的包；那真的是最佳实践。
• JD指向Google样式指南也是一个好选择。那不是唯一的样式指南，例如Henrik的R编码约定比它早几年；还有 Hadley基于Google样式指南的演绎。
• 否则，老生常谈的“做您的同事和合作者所做的”也适用。

- Dirk Eddelbuettel

Answer 2

我推荐使用Josh Reich的"Load, Clean, Func, Do"工作流程，可以从这个之前的问题中了解更多。

此外，我建议遵循编码指南，比如Google的R风格指南。使用编码风格指南可以使以后阅读代码变得更加容易。

- JD Long

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我希望那个风格指南不要支持“点”命名法（例如some.variable.name）。虽然它已经有了悠久的历史，并且大多数R代码都是这样编写的，但我并不喜欢它。 - doug

我同意Doug的观点。我自己使用驼峰命名法。风格指南和版本控制一样，不是关于你选择哪一个，而是选择一个并使用它。 - JD Long

Answer 3

我完全同意现有答案的观点，尤其是在包的使用方面。包需要很高的纪律性、文档和结构化，这些都能帮助强制执行最佳实践（还有 R CMD CHECK）。您还可以使用codetools 包来帮助解决这个问题。使用 roxygen 包进行文档编写。

除此之外，我建议您不仅向量化代码，更要尤其注意向量化您的函数。这意味着您应该能够提供向量参数并获得向量返回（即使从数据库调用等情况中也是如此）。长期来看，这将真正提高您的代码效率和清晰度。

最后，我真的喜欢使用类似 Sweave 的东西，以清晰的可重复研究方式组织我的代码，每当写报告时。同时我也推荐使用 cache 包。

- Shane

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谢谢你的回答，Shane。 你有使用“codetools”包的例子吗？ - Tal Galili

Answer 4

为了提高效率，应优先使用向量运算而非for循环。

- Frank

Answer 5

一般来说，这是良好的编程实践，但使用诸如SVN之类的版本控制系统来管理您的代码更加可取。

- stevejb