迷你安装的conda与dockerfile，如何使用conda环境

Question

目标: 使用miniconda创建一个docker镜像，该镜像将安装所有依赖项，然后运行一些关于Django和其他包的命令。每当有人bin/bash进入容器时，它都应该从可用的包开始，而无需我添加entrypoint并在那里进行env hacks。

Dockerfile:
FROM continuumio/miniconda3
ADD environment.yml /code/
WORKDIR /code/
RUN conda env create -f environment.yml  # successful
RUN python test/manage.py 8000  # fails, no dependencies like pandas installed

但是现在我卡住了，假设我想在创建的环境中运行一些命令：

RUN python manage.py runserver 

我的环境无法运行它。

这里有一些不太好看的hack: https://github.com/ContinuumIO/docker-images/issues/89，但它们实际上不起作用，因为当您进入容器或执行另一个RUN命令时，您使用的是新的shell会话，因此您必须使用 && 将命令串联在一起（很丑陋）。

理想情况下，我想从environment.yml全局安装所有conda包，但显然我做不到。

- Claudiu Creanga

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嗨，Claudiu，你确定你的Dockerfile有效吗？你最后的命令应该将环境文件引用为/code/environment.yml。你能发一下你运行的docker命令吗？ - Mihai

相关问题仍然未解决。 - amanb

@Mihai 是的，抱歉，我有一个 WORKDIR /code/，为了简洁起见，我没有包含它。 - Claudiu Creanga

@Mihai 已更新，是的，运行成功。 - Claudiu Creanga

从Docker的角度来看，这应该可以工作。我不熟悉conda或Python，但是运行测试并在互联网上查找后，我发现在使用环境之前也应该激活它（conda activate <env name>）。我相信你比我更了解，但你能否尝试添加这一步骤，或者你已经知道它不需要吗？否则，你能否把我需要运行和测试的文件传给我？ - Mihai

Answer 1

您需要告诉Docker，conda管理的Python版本在哪里，而在Docker内部，可以通过conda run来实现。

conda run --no-capture-output -n myenv python run.py

Source https://pythonspeed.com/articles/activate-conda-dockerfile/

- bluesmonk