我正在尝试使用Python、NetworkX和Matplotlib输出一个力导向图的PNG。以下是当前的效果：
如您所见，这种排版更加易读且具有视觉吸引力，因为节点间距更大，簇更加紧密，白色空间较少。
尽管我阅读了我能找到的所有主题，并尝试了几十次节点大小、图形大小、边缘权重以及边缘长度属性（似乎没有什么作用，但可能是因为它是任意属性），但我无法使matplotlib图表看起来像d3.js一样，即使两个图表都是使用完全相同的节点、节点大小和边缘创建的。
不幸的是，在d3.js中创建它们并不是一个真正的选择，因为我希望创建成千上万个静态PNG，并且我不想在浏览器中渲染它们然后截屏！
因此，我的问题是：是否（a）有改善matplotlib布局的方法（通过增加边缘长度和/或避免节点重叠和/或减少空格），（b）输出d3.js力导向图为PNG（或任何静态格式）的方法，或者（c）我可以使用其他库来输出格式更好的力导向图像？
graphviz_layout()而不是spring_layout()（感谢在这里找到的提示）。这需要安装一些额外的库，因此我会记录我所做的事情（在Ubuntu 16.04上），以防有人遇到类似的问题。graphviz_layout()，您首先必须导入它（from networkx.drawing.nx_agraph import graphviz_layout）。但是，您还需要安装pygraphviz，这似乎没有作为依赖项安装。pygraphviz，我需要按照以下步骤进行操作（感谢此线程上的帖子）：
sudo pip install pygraphviz --install-option="--include-path=/usr/include/graphviz" --install-option="--library-path=/usr/lib/graphviz/"
使用graphviz_layout()进行可视化似乎比spring_layout()具有更少的节点重叠，并且在一般情况下具有更美观的间距。请参见下面的输出（与问题帖子中的第一张图像进行比较）：
working networkx/matplotlib/pygraphviz force graph
这需要大量调整才能正确完成，因此我希望对于有类似要求的其他人有所帮助！
iterations参数，它显示了我推测的图形动画中不同点的位置，例如：pos = nx.spring_layout(G, iterations=100) nx.draw(G, pos)这 可能 有用，但我不确定如何确定什么数量的迭代对于不同大小的图最理想...而且，d3.js所有这些都是自动完成的。 - Chris