为什么R的热力图函数不能一致地对单元格进行着色？

Question

在R中，heatmap函数旨在帮助人们解释矩阵元素的相对值。然而，在同一图中，它似乎不能一致地给单元格着色，这是正确解释相对值的严重障碍。

例如，让我们通过连接正态随机变量的列来生成一些数据：

foo <- cbind(replicate(10,rnorm(10)))

现在，如果我们将foo的列进行相关，我们可以验证对角线条目中会得到1，因为任何一列与自身的相关性都是1。

cor.matrix <- cor(foo)

但是当我们绘制图表时：

heatmap(cor.matrix,Rowv=NA,Colv=NA)

这里我们抑制了树形图的重新排列，尽管这似乎并不重要。

正如你所看到的，对角线上的单元格并没有统一着色:

有人可以解释一下这里发生了什么吗?

- wvoq

Answer 1

默认情况下，热力图按“行”进行缩放。

heatmap(cor.matrix,Rowv=NA,Colv=NA, scale="none")

- IRTFM