不支持的HDF5版本。

Question

我正在尝试安装Pytables，并且已经安装了几乎全部的依赖项：然而，当我尝试安装Pytables时：

* Found numpy 1.7.0b1 package installed.
* Found numexpr 2.0.1 package installed.
* Found Cython 0.16 package installed.
* Found HDF5 headers at ``/home/xug/pytables/hdf5/include``, library at ``/home/xug/pytables/hdf5/lib``.
.. ERROR:: Unsupported HDF5 version!

“unsupported HDF5 version”指的是不支持的HDF5版本。

- LookIntoEast

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问题已解决，因为Pytables需要至少HDF-1.8.4版本。 - LookIntoEast

很高兴你解决了它！如果您能将此评论重写为常规答案并将其标记为已接受（这样其他人就可以立即知道这是一个已解决的问题），那就太好了。 - Simon

Answer 1

尽管问题的作者已经在评论中回答了它，但我认为在这里提供一个可能更加详细的答案是合适的。

如前所述，该问题是由于系统范围内的HDF5库版本错误（或缺失）引起的。在我的情况下，我通过编译更新的版本并将其本地安装来解决该问题：

$ wget http://www.hdfgroup.org/ftp/HDF5/current/src/hdf5-1.8.11.tar.bz2
$ tar xjvf hdf5-1.8.11.tar.bz2
$ cd hdf5-1.8.11
$ configure --prefix=~/localroot
$ make -j 8
$ make install

在编译软件包之前，需要指定本地安装的路径：

$ export HDF5_DIR=~/localroot
$ pip install tables

最后，PyTables需要~/localroot/lib在LD_LIBRARY_PATH中才能正常工作，因此我添加了以下这行代码。

export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:~/localroot/lib

至~/.bashrc

- KT.