BLAS/LAPACK未安装：如何安装？

Question

BLAS/LAPACK未安装：如何安装？

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我正在尝试在python2.7中运行“pip install tsne”，但我一直收到相同的错误。我遵循了http://bickson.blogspot.com/2011/02/installing-blaslapackitpp-on-amaon-ec2.html上的说明并安装了LAPACK / BLAS，我认为这应该解决了问题。但没有帮助。我做错了什么？我对bash不太熟悉。

running build_ext
将tsne / bh_sne.pyx转换为tsne / bh_sne.cpp

创建“bh_sne”扩展
创建build / temp.linux-x86_64-2.7
创建build / temp.linux-x86_64-2.7 / tsne

创建build / temp.linux-x86_64-2.7 / tsne / bh_sne_src
x86_64-linux-gnu-gcc -pthread -fno-strict-aliasing -DNDEBUG -g -fwrapv -O2 -Wall -Wstrict-prototypes -fPIC -I/home/ubuntu/env/work/local/lib/python2.7/site-packages/numpy/core/include -I/usr/local/include -Itsne/bh_sne_src/ -I/usr/include/python2.7 -c tsne/bh_sne_src/quadtree.cpp -o build/temp.linux-x86_64-2.7/tsne/bh_sne_src/quadtree.o -msse2 -O3 -fPIC -w
cc1plus：警告：命令行选项“-Wstrict-prototypes”对C / ObjC有效，但对C ++无效[默认情况下启用]x86_64-linux-gnu-gcc -pthread -fno-strict-aliasing -DNDEBUG -g -fwrapv -O2 -Wall -Wstrict-prototypes -fPIC -I/home/ubuntu/env/work/local/lib/python2.7/site-packages/numpy/core/include -I/usr/local/include -Itsne/bh_sne_src/ -I/usr/include/python2.7 -c tsne/bh_sne_src/tsne.cpp -o build/temp.linux-x86_64-2.7/tsne/bh_sne_src/tsne.o -msse2 -O3 -fPIC -w
cc1plus: 警告：命令行选项"-Wstrict-prototypes"只在C/ObjC中有效，而不适用于C++ [默认启用]
x86_64-linux-gnu-gcc -pthread -fno-strict-aliasing -DNDEBUG -g -fwrapv -O2 -Wall -Wstrict-prototypes -fPIC -I/home/ubuntu/env/work/local/lib/python2.7/site-packages/numpy/core/include -I/usr/local/include -Itsne/bh_sne_src/ -I/usr/include/python2.7 -c tsne/bh_sne.cpp -o build/temp.linux-x86_64-2.7/tsne/bh_sne.o -msse2 -O3 -fPIC -w
cc1plus: 警告：命令行选项"-Wstrict-prototypes"只在C/ObjC中有效，而不适用于C++ [默认启用]c++ -pthread -shared -Wl，-O1 -Wl,-Bsymbolic-functions -Wl,-Bsymbolic-functions -Wl，-z，relro -fno-strict-aliasing -DNDEBUG -g -fwrapv -O2 -Wall -Wstrict-prototypes -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security build/temp.linux-x86_64-2.7/tsne/bh_sne_src/quadtree.o build/temp.linux-x86_64-2.7/tsne/bh_sne_src/tsne.o build/temp.linux-x86_64-2.7/tsne/bh_sne.o -L/usr/local/lib -o build/lib.linux-x86_64-2.7/bh_sne.so -lcblas
/usr/bin/ld: 找不到-lcblas
collect2: 错误：ld 返回了 1 的状态
错误：命令'c++' 失败，退出状态为1
----------------------------------------
正在清理...
命令 /home/ubuntu/env/work/bin/python -c "import setuptools, tokenize;__file__='/home/ubuntu/env/work/build/tsne/setup.py';exec(compile(getattr(tokenize, 'open', open)(__file__).read().replace('\r\n', '\n'), __file__, 'exec'))" install --record /tmp/pip-3X17dU-record/install-record.txt --single-version-externally-managed --compile --install-headers /home/ubuntu/env/work/include/site/python2.7 失败，出现错误代码1于/home/ubuntu/env/work/build/tsne
回溯（most recent call last）：
  File "/home/ubuntu/env/work/bin/pip", line 11, in 
    sys.exit(main())
  File "/home/ubuntu/env/work/local/lib/python2.7/site-packages/pip/__init__.py", line 185, in main
    return command.main(cmd_args)
  File "/home/ubuntu/env/work/local/lib/python2.7/site-packages/pip/basecommand.py", line 161, in main
    text = '\n'.join(complete_log)
UnicodeDecodeError：'ascii' 编解码器无法解码第42个位置的0xe2字节：该数值不在指定的范围内128。

- pg2455

请验证在\usr\local\lib目录下是否确实存在名为libcblas.a或libcblas.so的库。 - Roland Smith

3个回答

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请使用以下内容：

sudo apt-get install libblas-dev liblapack-dev

- Harsh Wardhan

2

下载OpenBLAS的副本并自行编译。使用make install将其安装到/usr/local中。官方存储库中有OpenBLAS和ATLAS包以及其他任何内容，但它们的性能值得怀疑。

- tmyklebu

警告：OpenBLAS没有cblas符号。 - ndtreviv

网页内容由stack overflow 提供, 点击上面的

可以查看英文原文，
原文链接

- Michel Müller · Accepted Answer

根据他们的github，tsne需要cblas或openblas二进制分发版，但Ubuntu没有。不过，ATLAS在Ubuntu上可用，并且预编译了cblas。

在Ubuntu、Debian上，应该可以使用以下命令：

apt-get install libatlas-base-dev

https://launchpad.net/ubuntu/+source/atlas

如果您需要使用不同的编译选项，您需要自己构建openblas。

并且检查在/usr/lib中是否有libcblas.a文件。

编辑：已更正软件包名称。