在Visual Studio 2013和Visual C++ 2013上使用HDF5入门

Question

我正在尝试在Visual Studio 2013（C ++）中使用HDF5示例，但遇到了困难。

示例代码可以在这里找到：http://www.hdfgroup.org/ftp/HDF5/examples/misc-examples/stratt.cpp ，我也将代码完整地贴在下面。

我的第一个问题是：最新的HDF5（版本1.8.13）是否能与Visual C++ 2013一起使用？文档中只提到了2012年，但是通常情况下，在文档中提到2012年的地方，我使用2013年并没有出现问题。

我尝试将示例程序作为32位和64位应用程序运行。我最终希望使用64位。对于32位的项目设置，在VC ++设置下，我添加了包含目录：C：\Program Files (x86)\HDF_Group\HDF5\1.8.13\include。对于库目录，我添加了：C：\Program Files (x86)\HDF_Group\HDF5\1.8.13\lib。

对于链接器->输入，我添加了：hdf5.lib; hdf5_cpp.lib。当我运行时，我收到了消息：“程序无法启动，因为计算机上缺少hdf5.dll...”这不出乎意料。所以我从目录C:\Program Files (x86)\HDF_Group\HDF5\1.8.13\bin中添加了hdf5.dll和hdf5_cpp.dll到调试目录。

然后我得到了运行时错误：“应用程序无法正常启动（0xc000007b）。单击“确定”关闭应用程序。 有什么想法吗？

顺便说一句，当我尝试使用64位设置、目录和文件运行x64位版本时，会出现略有不同的错误。程序一直到最后都在运行，但控制台没有写入任何属性，没有生成文件，并且在最后（在按下最后一行上的f10之后）出现了可怕的错误：

Unhandled exception at 0x000007FEF05E512D (msvcp120d.dll) in HDF5AttributeExample2.exe: 0xC0000005: Access violation reading location 0xFFFFFFFFFFFFFFFF。

在这两种情况下（32位和64位），我的直觉告诉我，我有某种配置问题（错误的lib、错误的设置等）。如果有人能提供任何帮助或建议，我将不胜感激。

如果有其他Visual C++ HDF5示例，请务必告诉我！

谢谢，

戴夫

#include <string>
#include <iostream>

#include "H5Cpp.h"

using std::cout;
using std::endl;

using namespace H5;

const H5std_string FILE_NAME("string_test.h5");
 const H5std_string DS_NAME("Data Set 1");
const H5std_string ATTR_NAME("String Attribute");

int main(void) {

// Create the named file
H5File file = H5File(FILE_NAME, H5F_ACC_TRUNC);

// Create new dataspace for the dataset
const int rank = 3;
const int dim1 = 2;
const int dim2 = 2;
const int dim3 = 2;
hsize_t  dims[rank] = { dim1, dim2, dim3 };
DataSpace dataspace = DataSpace(rank, dims);

// Create new datatype for the dataset
FloatType datatype(PredType::NATIVE_FLOAT);

// Create the dataset
DataSet dataset = file.createDataSet(DS_NAME, datatype, dataspace);

// Set up write buffer 'matrix'
int q, r, s;
float value;
float matrix[dim1][dim2][dim3];
for (q = 0; q < dim1; q++)
for (r = 0; r < dim2; r++)
for (s = 0; s < dim3; s++)
{
    value = 1.111 + (q * r * s);
    matrix[q][r][s] = value;
}

// Write data to the dataset
dataset.write(matrix, datatype);

// Create new dataspace for attribute
DataSpace attr_dataspace = DataSpace(H5S_SCALAR);

// Create new string datatype for attribute
StrType strdatatype(PredType::C_S1, 256); // of length 256 characters

// Set up write buffer for attribute
const H5std_string strwritebuf("This attribute is of type StrType");

// Create attribute and write to it
Attribute myatt_in = dataset.createAttribute(ATTR_NAME, strdatatype, attr_dataspace);
myatt_in.write(strdatatype, strwritebuf);

// Set up read buffer for attribute
H5std_string strreadbuf("");

// Open attribute and read its contents
Attribute myatt_out = dataset.openAttribute(ATTR_NAME);
myatt_out.read(strdatatype, strreadbuf);

// Display attribute contents
cout << "Attribute contents: " << strreadbuf << endl;

return 0;
}

- Dave

Answer 1

您遇到的运行时错误是由于您使用了使用VS2012编译的库所致。

来自HDF Group 网站关于VisualStudio和CMake：

首先，请确保您使用与创建预构建二进制文件所使用的Visual Studio版本相同。这是为了避免运行时错误。

我建议您尝试使用CMake在VS2013上构建源代码。

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好的，经过我自己的尝试，我成功地将它编译到了VS2013 Ultimate，并且支持32位和64位。

• 下载源代码并解压。假设目录名为“source”。
• 下载CMake并打开GUI，选择源位置和一个“构建”位置。
• 单击“Configure”并选择您正在使用的Visual Studio版本。
• 配置选项将在CMake上以红色显示。选择您需要的任何内容。
• 单击生成。
• 转到“build”文件夹并打开生成的MSVS解决方案。构建解决方案。
• 在同一构建文件夹中运行命令“cpack -C {Debug | Release} ---config C:\...\"build"\CPackConfig.cmake。这将为文件创建安装程序。
• 运行此安装程序。
• 在MSVS中创建一个空项目。转到项目配置属性。然后选择C/C++->常规->附加包含目录并插入C:\Program Files (x86)\HDF_Group\HDF5\1.8.13\include。根据需要更改此路径。如果您使用的是x64版本，则需要将此窗口顶部的平台更改为x64。如果不存在，请单击“配置管理器”，从“活动解决方案平台”下拉菜单中选择“新建”。添加x64选项。
• 现在转到添加C:\Program Files (x86)\HDF_Group\HDF5\1.8.13\lib。同样根据需要更改此内容。请注意，如果您为x64构建了二进制文件，则它们将安装在C:\Program Files\HDF_Group\HDF5\1.8.13\。
• 转到。添加libhdf5_D.lib和libhdf5_cpp_D.lib（如果将其构建为调试版本），否则（我认为）使用hdf5.lib和hdf5_cpp.lib。

祝你好运！

- Rick

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在HDF5 rev 1.10.4（以及可能的较早版本）中，这甚至更容易。在VS中完成初始构建后，您只需在解决方案资源管理器中构建“INSTALL”目标，安装便会继续进行。然后按照上面回答中描述的项目配置说明进行操作，根据版本适当修改路径。尽管已经是2019年，但我仍使用VS 2013。 - mklein9

Answer 2

根据浏览量来看，似乎没有太多人对使用Visual C++进行HDF5操作感兴趣。也许这应该是对我的警告！无论如何，为了后代，我提供以下答案以回答我的原始问题。

首先，必须非常小心在环境设置中正确设置路径变量，并且根据需要设置正确的32位或64位。
不要使用： C:\Program Files (x86)\HDF_Group\HDF5\1.8.13\bin 而是使用： C:\Program Files (x86)\HDF Group\HDF5\1.8.13\bin（注意缺少下划线）

此外，必须注意您想要32位（使用Program File（x86））还是64位（使用Program Files）。如果有人知道在同一台机器上运行使用HDf5的32位和64位程序的更简单方法，请告诉我。

另一个主要问题是示例代码本身。原始形式下它无法工作。经过多次尝试，我发现问题出在使用H5std_string上。当我将它们替换为char []时，一切都能正常工作。例如，不要使用： const H5std_string FILE_NAME("string_test.h5"); 而是使用： char fileName[128] = "string_test.h5"; 然后像这样使用H5File构造函数： H5File file = H5File(fileName, H5F_ACC_TRUNC); 很烦人的是我没有得到编译时错误。构造函数在H5File的构造函数中声称需要std::string（这就是H5std_string所代表的）。很可能，有一些Visual Studio设置可以使原始代码正常工作。但我对Visual C++的知识不够。

无论如何，祝大家好运。

戴夫

- Dave