无法在Ubuntu 11.10中安装rdkit

Question

我花费了很多时间尝试在ubuntu 11.10上为Python 2.7 (rdkit_201106+dfsg.orig.tar.gz)构建RDKit，使用了预编译版本的boost 1.49。但我失败了。

错误一直出现在CMake GUI中：

 CMake Error at CMakeLists.txt:11 (install):

  install FILES given no DESTINATION!



  CMake Error at CMakeLists.txt:14 (add_pytest):


  Unknown CMake command "add_pytest".

有什么需要帮忙的吗？

我解决了之前的问题，但是现在当我运行Python时，尽管我按照安装程序安装了rdkit，但我仍然遇到了这个错误：

 from rdkit import Chem
 Traceback (most recent call last):
   File "<stdin>", line 1, in <module>
 ImportError: No module named rdkit

- zinon

Answer 1

确保你已经设置了环境变量：（你可能需要根据自己的情况修正路径）在mac上使用bash：

export RDBASE=/usr/local/share/RDKit
export PYTHONPATH=$PYTHONPATH:/usr/local/lib/python2.7/site-packages

您可能希望将这些行添加到bash脚本中以自动化该过程。

- deddu

Answer 2

在Ubuntu 12.04.2 LTS中，设置这些环境变量对我有用。

export RDBASE=/usr/share/RDKit
export PYTHONPATH=$PYTHONPATH:/usr/lib/pymodules/python2.7

- amorales