安装 Rstudio Docker 的软件包

Question

我将尝试使用Rstudio docker在DigitalOcean服务器上运行Rstudio。由于我对Linux服务器的经验有限，这对我来说是一个挑战。

我可以通过以下步骤启动和运行Rstudio：

docker run -dp 8787:8787 -v /root:/home/rstudio/ -e ROOT=TRUE rocker/hadleyverse

然而，当我不使用服务器时，希望能够关闭服务器并将其保存到快照中，但不必每次重新安装软件包。

使用docker更新映像的文档，我可以创建一个容器，在该容器上安装软件包，然后提交更改：

docker run -t -i rocker/hadleyverse /bin/bash
install.r randomForest
exit
docker commit \<CONTAINER_ID> michael91/ms:v1

然而，一旦我提交了代码，我就无法正确地运行更新后的镜像。我尝试按照以下方式运行它：

docker run -dp 8787:8787 -v /root:/home/rstudio/ -e ROOT=TRUE michael91/ms:v1

当我这样做时，Rstudio服务器没有激活，而当我运行原始的rocker/hadleyverse版本时则会激活。我尝试过安装和不安装软件包来进行提交；但无论哪种方式似乎都不起作用。显然我做错了什么，但我不确定是什么。如果有人能给我一些指导，我将非常感激。

编辑：非常感谢VonC；那解决了问题。

- micsadow

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太好了！欢迎来到 Stack Overflow。别忘了参观一下导览页面（http://stackoverflow.com/tour）并阅读 http://stackoverflow.com/help/accepted-answer。 - VonC

请注意，只需将默认命令附加到容器的末尾即可；例如 docker run -dp 8787:8787 -v /root:/home/rstudio/ -e ROOT=TRUE michael91/ms:v1 supervisord - cboettig

Answer 1

可能是因为新提交的镜像丢失了在rocker-org/rocker/rstudio/Dockerfile#L58中存在的CMD指令。

CMD ["/usr/bin/supervisord", "-c", "/etc/supervisor/conf.d /supervisord.conf"]

请尝试创建一个新的Dockerfile：

FROM michael91/ms:v1
## Add RStudio binaries to PATH
ENV PATH /usr/lib/rstudio-server/bin/:$PATH 
ENV LANG en_US.UTF-8
EXPOSE 8787

CMD ["/usr/bin/supervisord", "-c", "/etc/supervisor/conf.d/supervisord.conf"]

请将其构建为michael91/ms:v2。

然后，当激活RStudio时，看到v2比v1更有效：

docker run -dp 8787:8787 -v /root:/home/rstudio/ -e ROOT=TRUE michael91/ms:v2

- VonC