rgdal软件包安装

Question

这里的问题并不是如何通过R绘制地图，因为我已经找到了一个非常好的示例在这里，而是如何使它正常工作。事实上，我无法加载库rgdal：

library(rgdal)
Error in library(rgdal) : there is no package called ‘rgdal’

然而，当我尝试手动安装上述软件包时，我遇到了以下错误：

....
configure: error: proj_api.h not found in standard or given locations.
ERROR: configuration failed for package ‘rgdal’
* removing ‘/home/eualin/R/i686-pc-linux-gnu-library/2.15/rgdal’
Warning in install.packages : installation of package ‘/home/eualin/Downloads/rgdal_0.8-5.tar.gz’ had non-zero exit status

任何输入都受欢迎！

- user706838

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如果您使用的是类似于Debian的系统，请尝试安装“libproj-dev”软件包。 - juba

你用什么命令安装了你的软件包？ - juba

抱歉，我的意思是安装rgdal... 你使用的Debian版本是什么？ - juba

你是否使用了 install.packages("rgdal") 这个命令？ - juba

要将答案标记为正确，您可以勾选绿色标记。而且您不必点赞我发表的每个评论 :) 很高兴您解决了问题。 - juba

Answer 1

如果你查看CRAN上的包页面，你将会看到如下内容：

系统要求：为了从源代码构建：需要GDAL >= 1.7.1库，可以从http://trac.osgeo.org/gdal/wiki/DownloadSource下载，以及PROJ.4 (proj>=4.4.9)库，可以从http://trac.osgeo.org/proj/下载；在OSX上，可以使用由William Kyngesburye在http://www.kyngchaos.com/构建的GDAL OSX框架进行源码安装。

由于你似乎使用Linux系统，所以你需要在系统上安装相应的库来构建包。如果你使用的是Mint、Ubuntu或另一个Debian衍生版，你可以执行以下操作：

$ sudo apt-get install libgdal1-dev libproj-dev

如果你使用的是基于Debian的系统，那么一个有用的技巧是安装apt-file软件包并运行以下命令：

$ sudo apt-file update

然后，当您遇到以下错误时：

configure: error: proj_api.h not found in standard or given locations.

你可以使用以下命令查找需要安装的软件包以获取缺失的文件：

$ apt-file search proj_api.h
libproj-dev: /usr/include/proj_api.h

- juba

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对我来说并没有完全奏效，我使用运行在 Ubuntu 14.04 trusty 上的 Linux Mint 17.1 Rebecca -- apt-file 没有工作。我最终删除了 libproj-dev 并重新安装它，因为出现了一些损坏问题，然后安装了 libgdal1、libgdal1-dev 和依赖项（截至本文撰写时，官方仓库中的版本为 1.11.2，但我在这里看到了 version 2，所以可能会有变化）。 - MichaelChirico

如果您在未来且找不到libgdal1-dev，可能是因为GDAL 2已推出，软件包名称已删除数字，变为libgdal-dev。Ubuntu 18.04似乎是这样的情况。 - Tom Saleeba

我已安装了所有依赖项，但仍然遇到 configure: error: proj_api.h not found in standard or given locations. 的错误提示。proj_api.h也在 /usr/include 中找到了。有什么想法吗？ - ismailsunni

Answer 2

如果您使用带有Homebrew软件包管理器的OS X，并且通过homebrew-science tap安装了R，则可以通过首先安装gdal来安装rgdal。

brew install gdal

在运行此命令之前，您可能希望先列出可用选项，以防您需要像postgresql支持这样的高级功能。要查看可用选项，请输入：

brew options gdal

然后如果你想要花哨一点，可以输入

brew install --with-postgresql gdal

一段时间后，您应该可以使用依赖项了，因为 proj 包括所需的 proj_api.h 是依赖项！不幸的是，rgdal 目前仍无法找到 pro_api.h，因为它没有在 /usr/local/include 中查找。要修复这个问题以及 rgdal 安装可能出现的其他问题，请使用以下R命令安装 rgdal：

  > install.packages('rgdal', type = "source", configure.args=c('--with-proj-include=/usr/local/include','--with-proj-lib=/usr/local/lib'))

这应该与MacPorts类似，除了brew步骤之外，您的库/头文件很可能分别在“/opt/local/lib”和“/opt/local/include”下。

注意：对于brew升级程序，如果您使用"--with-armadillo"选项与gdal一起使用，并将armadillo从6升级到7。您需要在升级/重新安装rgdal之前重新编译gdal。

- Jonathan Lisic

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谢谢。根据其他发布的解决方案，经过几次失败后，您的方法在我的电脑上运行正常。 - HappyCoding

上帝派来了解决方案！我不知道我在这上面花了多少个小时。唉。 - josiekre

对我来说有效。唯一的问题是，在安装了rgdal包之后，我需要重新启动R。 - Stewart Macdonald

Answer 3

在使用R-3.2.0的Fedora 21系统上，以下方法可以成功：

yum install gdal.x86_64 gdal-devel.x86_64 gdal-libs.x86_64
yum install proj.x86_64 proj-devel.x86_64
yum install proj-epsg.x86_64 proj-nad.x86_64

显而易见，这是为了不断尝试获得以下结果：

install.packages("rgdal")

去工作吧。你可能可以一次性完成所有安装。

- jimlemon

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在Centos上对我有用。 - JaKu

我使用的是Fedora 27和R 3.4.3，这个答案仍然有效！ - Ondino

Answer 4

在Ubuntu Studio 14.04上（同样适用于所有Debian发行版）：

sudo apt-get install libproj-dev libgdal-dev

那么我可以安装rgdal软件包

R info:
R version 3.0.2 (2013-09-25) -- "Frisbee Sailing"

Linux info:
Linux francois-K53SV 3.13.0-34-lowlatency #60-Ubuntu SMP PREEMPT Wed Aug 13 16:15:18 UTC 2014 x86_64 x86_64 x86_64 GNU/Linux

- François Pelletier

Answer 5

这是我在Centos7上所做的：

yum install gdal gdal-devel
yum install proj-devel
yum install proj-nad
yum install proj-epsg

那么只需

install.packages("rgdal")

这样做很顺利，但并不十分清晰。

- Jacques Peeters

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刚在新的Centos 7上测试过，我认为你需要安装proj-devel而不仅仅是proj。否则，我们会得到configure: error: proj_api.h not found in standard or given locations错误提示。这是针对rgdal 1.2-6版本的。 - HenrikB

我需要版本大于2.0才能使用sf包。这些说明对我有用，尽管花了很长时间，请耐心等待。https://gis.stackexchange.com/questions/263495/how-to-install-gdal-on-centos-7-4 - Elin

同意@HenrikB的说法，我也需要proj-devel来解决同样的错误。你可能还需要使用sudo yum install ...命令。 - Brian D

这些天我在SO上有一些编辑权限，所以我更新了这个答案来安装proj-devel（而不仅仅是proj）。 - HenrikB

在Fedora上，我成功地执行了这个命令：dnf install gdal gdal-devel proj-devel proj-nad proj-epsg。 - There

在 Fedora 34 上，似乎可以使用 sudo dnf install gdal-devel proj-devel 命令安装成功。 - Roman Luštrik

Answer 6

对于 Ubuntu 16.04 和 R 3.5.1，这个方法运行很快：

sudo add-apt-repository -y ppa:ubuntugis/ubuntugis-unstable
sudo apt update
sudo apt install gdal-bin python-gdal python3-gdal libgdal1-dev

然后；

sudo apt-get install libudunits2-dev libgdal-dev libgeos-dev libproj-dev

终于在CRAN上发布了；

install.packages("rgdal")

- DSA

Answer 7

在OSX操作系统上，我从http://www.kyngchaos.com/software/frameworks下载了proj，并在R中执行了以下命令。

install.packages('rgdal', type = "source", configure.args=c('--with-proj-include=/Library/Frameworks/PROJ.framework/Headers', '--with-proj-lib=/Library/Frameworks/PROJ.framework/unix/lib'))

- matiskay

Answer 8

这是我试过的方法：

这个对我有用：

install.packages('rgdal',repos="http://www.stats.ox.ac.uk/pub/RWin")

- RoyalTS

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这是我在所有搜索中找到的唯一可行的方法。 - podcastfan88

Answer 9

对于我（Ubuntu 16.04，R 3.4.2），上述解决方案的混合使用起作用：

sudo apt-get install libudunits2-dev libgdal-dev libgeos-dev libproj-dev

然后，只需从CRAN安装rgdal即可。

- jogall

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感谢您提供这个。我已经成功在Ubuntu 16.04上运行它了。 - Gabriel Fair

那个最终在我使用Ubuntu 18.04时成功了。谢谢。 - Joni Hoppen

Answer 10

对于Mac（OS.X版本10.12.6）用户，这对我有用。首先，打开命令行并使用 >> brew install gdal 安装gdal。其次，进入Rstuduio（R控制台）并使用 install.packages("rgdal") 安装软件包。

- ewalel