如何使用RDFLib将图表导出为RDF文件

Question

我正在尝试使用Python 3.4中的RDFLib生成RDF数据。

一个最简单的例子：

from rdflib import Namespace, URIRef, Graph
from rdflib.namespace import RDF, FOAF

data = Namespace("http://www.example.org#")

g = Graph()

g.add( (URIRef(data.Alice), RDF.type , FOAF.person) )
g.add( (URIRef(data.Bob), RDF.type , FOAF.person) )
g.add( (URIRef(data.Alice), FOAF.knows, URIRef(data.Bob)) )

#write attempt
file = open("output.txt", mode="w")
file.write(g.serialize(format='turtle'))

该代码导致以下错误：

file.write(g.serialize(format='turtle'))
TypeError : must be str, not bytes

如果我用以下内容替换最后一行：

file.write(str(g.serialize(format='turtle')))

我没有收到错误提示，但结果是二进制流的字符串表示（一行以 b' 开头的文本）：

b'@prefix ns1: <http://xmlns.com/foaf/0.1/> .\n@prefix rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#> .\n@prefix rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#> .\n@prefix xml: <http://www.w3.org/XML/1998/namespace> .\n@prefix xsd: <http://www.w3.org/2001/XMLSchema#> .\n\n<http://www.example.org#Alice> a ns1:person ;\n    ns1:knows <http://www.example.org#Bob> .\n\n<http://www.example.org#Bob> a ns1:person .\n\n'

问题如何正确将图表导出到文件中？

- Arthur Vaïsse

Answer 1

serialize方法 接受一个目标关键字作为文件路径。在您的示例中，您需要使用:

g.serialize(destination='output.txt', format='turtle')

与其

file = open("output.txt", "w")
file.write(g.serialize(format='turtle'))

- Ted Lawless

---

@lawlesst：我遇到了同样的问题，但如果我不想更改目录，串行器就可以正常工作，但是一旦我将其更改为另一个驱动器，它会返回 IOError: [Errno 2] No such file or directory: Skane/Output/Skane/ontolog_output/NVDB_RA1/NVDB_RNO_V5042_RDF.owl。如您所见，目录名称丢失了，这是因为使用了 urlparse() 函数。我是漏掉了什么还是代码中有 bug？ - msc87

@msc87 我没有遇到过这个问题。RDFLib 可以将文件序列化到其他路径。我经常使用它。你是否提供了绝对文件路径？我建议尝试一下。同时，尝试使用类似于“/tmp/myfile.owl”的路径，看看是否会出现类似的错误。 - Ted Lawless

@lawlesst：D:/Skane/Output/Skane/ontolog_output/NVDB_RA1/NVDB_RNO_V5042_RDF.owl 是我定义的路径。它在 /tmp 中没有返回任何错误，并且文件已创建。使用 Skane/Output/Skane/ontolog_output/NVDB_RA1/NVDB_RNO_V5042_RDF.owl 也可以，在 c 目录中创建该文件，但如果我将其更改为 D，它会返回错误，如果我使用 "d"，则不会返回错误，也不会创建该文件。 - msc87

@msc87 这似乎是一个Windows文件路径问题。需要对反斜杠进行转义。请参考《Dive into Python》中的这篇入门文章。 - Ted Lawless

Answer 2

我在使用Python 3.7.3时遇到了完全相同的问题。如前面的回答建议的使用“destination”参数并不能帮助我，因为我想将三元组附加到RDF文件中。我理解问题出在Python3中，字节是替换Python2字符串的数据结构。将序列化方法的“encoding”参数设置为UTF-8也没有起作用。我在这个帖子中找到了一个有效的解决方案：对生成的字符串进行解码。

g.serialize(format='turtle')

"最初的回答"：使用

g.serialize(format='turtle').decode('utf-8')

最初的回答。无论您使用哪种格式。希望这能帮到你。

- Polina

---

非常感谢，这正是我们在重构代码以处理Unicode时遇到的问题。 - Paco

Answer 3

在函数中写文件名对我有用：

g.serialize('output_file.ttl',format='ttl')

- Enayat

Answer 4

- Anonymous

---

欢迎来到 Stack Overflow。当您发布答案时，请解释您发布的代码，并提供一些细节。请参阅：https://stackoverflow.com/help/how-to-answer - Fukiyel

请在答案中对您的代码进行一些解释。 - Partho63