如何比较并检查两个二进制（h5）文件是否在数值上具有相同的内容

Question

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我正在尝试比较两个二进制文件的内容。我使用Python 3.6 filecomp比较两个目录中同名的文件。

results_dummy=filecmp.cmpfiles(dir1, dir2, common, shallow=True)

上面的代码适用于我在两个目录中都有的*.bin文件，但它不能用于h5文件。

当比较包含完全相同组/数据集和数值数据的两个hdf5文件时，filecmp.cmpfiles将它们视为不匹配。

有没有办法从Python脚本内部比较两个hdf5文件的内容，而不使用h5diff？

提前感谢。

- Heli

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你的HDF5文件是否二进制相同（逐字节）？filecmp只能比较原始文件内容 - 不能进行数据解释。 - randomir

@randomir cmp -b file1.h5 file2.h5 表明这两个文件不是二进制相等的。这两个文件具有相同的内容，因此差异应该与 hdf5 的内部格式有关。无论如何，检查这两个文件是否包含相同的内容是我唯一关心的事情。有没有办法从 Python 中检查这一点呢？ - Heli

快速的谷歌搜索让我找到了这个GitHub项目。它使用h5py来加载两个文件并比较它们的内容。在类似的SO问题的答案中，提出了一个工具hdiff，但链接已经失效。此外，如果您知道h5diff，为什么不使用它（从Python）？ - randomir

@randomir我不想使用hdiff，因为我试图避免用户必须安装hdf5/Tools API才能运行脚本。 - Heli

1个回答

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原文链接

- Heli · Accepted Answer

我最终使用h5diff进行设置。脚本的用户需要安装hdf5/Tools才能运行该脚本。

谢谢你的回答。