R CMD roxygen未被识别。

Question

我刚刚尝试了Roxygen包。在R中，我可以运行Roxygen Vignette中的示例。但是在命令行中，R CMD roxygen不被识别为有效命令。当我运行R CMD --help时，我可以看到所有INSTALL, check, ...sweave..., config...命令项，但没有roxygen。有人能帮我解决这个问题吗？除了install.packages("roxygen")之外，是否需要其他安装步骤？我使用的是Windows 32位，R版本为2.12.0，并且工作Rtools环境。谢谢。

- user_roxygen

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我也在使用Windows，但我使用Cygwin Bash shell。如果我运行R CMD roxygen.sh（注意，是.sh），它可以工作。然而，如果我使用Windows命令行，它就无法工作了（当然不行，因为这是一个shell脚本...）。 - Bernd Weiss

Answer 1

如果我没记错的话，你必须从源代码安装软件包，这样它们才能提供额外的命令给R CMD。这是因为安装新的R CMD命令有点像黑客行为---需要劫持配置脚本或Makefile，并让它们将文件复制到R二进制文件目录中。从二进制文件安装软件包只是解压缩一个存档文件，configure和make不会运行。

所以尝试install.packages('roxygen', type='source')。在Windows上，你需要安装RTools才能使其工作。

- Sharpie

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谢谢。我也遇到了同样的问题。以管理员身份从源代码安装解决了它。 - Ian Fellows

Answer 2

我前几天也遇到了这个问题。我以管理员身份安装，解决了这个问题。只需以管理员身份运行R，然后像平常一样执行install.packages，最后重启R，因为你不想一直以管理员身份运行。

- Andrew Redd

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刚刚进行了全新的安装，但好像并没有解决问题，很抱歉，我也不太确定是如何让它工作的。 - Andrew Redd

我在Ubuntu上遇到了这个问题，不得不使用'sudo R'命令然后安装该软件包。 - JD Long

Answer 3

这是我发现在Windows的命令行（DOS）中使用roxygen2时有用的解决方法。其中很多材料都来自这里。

创建文件roxy.R，包含以下内容：

library(methods)
library(utils)
require(roxygen2)
roxygenize("myPackage")

首先，您需要使用roxygen或其他相关参数。

然后，创建批处理文件f.bat，并将其内容设置为：

Rscript roxy.R

然后在命令行中运行f：

> f

注意:

确保 Rscript.exe 在你的路径中。它通常可以在类似 c:\r:\bin\ 的地方找到。

(在Windows中编辑路径，右键单击“我的电脑”，然后选择“属性”，然后选择左侧菜单上的“高级系统设置”，然后选择“高级”选项卡，“环境变量”按钮，“系统变量”，“Path”。)

- dardisco

Answer 4

我在Windows上进行了测试。 R CMD %R_home%\bin\roxygen.sh 可以工作。 但是在DOS命令下，R CMD roxygen.sh 和 R CMD roxygen 都无法工作。尽管已将 .sh 关联到 sh.exe，并且 %R_home%\bin\ 已添加到系统路径中。 使用 R CMD INSTALL 或 install.packages(type='source') 进行源代码安装时也是如此。

- user914532