为什么在RStudio中使用GGally::ggpairs比基础版R慢得多？

Question

根据标题，有人知道为什么在RStudio中从GGally包中呈现一个ggpairs图需要比在基本的R（或终端）中花费更长的时间吗？

例如：

start.time <- Sys.time()
ggpairs(mtcars)
end.time <- Sys.time()
time.taken <- end.time - start.time
time.taken

在我的电脑上，在RStudio中运行此程序所需的时间大约比基本R长5倍。我不管是在Windows还是Mac操作系统下都遇到了相同的减速问题。

是否有任何解决方法？

其他软件包？

具体地说，如何快速地呈现像这样的内容：GGally :: ggpairs（iris，color =“Species”），而不离开RStudio？

- JasonAizkalns

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这只是RStudio的内部图形设备吗？如果启动一个独立的图形设备会发生什么？它还是很慢吗？[不确定如何在Windows R中启动一个，Unix R上是“X11()”....] - Spacedman

看起来是这样。在RStudio中使用x11()，然后绘图，最后使用dev.off()可以显著加快速度。 - JasonAizkalns

可能是因为RStudio图形设备进行了抗锯齿和透明处理。 - Spacedman

Answer 1

我遇到了类似的问题，花费了一些时间来尝试弄清楚原因。我发现了四个重要的问题（不是详尽无遗的列表）。如果你的情况和我的相似，那么1和2是你最主要的关注点。

1. 集成开发环境。RStudio在执行ggpairs时比R慢。
2. 计算环境。我没有足够的资源来对此进行全面测试，但我们很可能在谈论GPU，因为这是一个图形处理问题。
3. 变量数量。变量越多，时间呈指数级增长。
4. 连续操作。如果你在使用低功率机器工作，过多的请求会减缓执行速度。

你可以在我的github上阅读更多信息：https://github.com/zstachniak/Elapsed-Time-Pairwise-Functions/blob/master/ggpairs.md

- zstachniak