故障排除：无法找到多边形边缘

Question

有人知道这个错误消息是什么意思吗？我试图将字体更改为Helvetica，然后对于小数据框它可以工作。但是，当我尝试绘制大数据框时，错误再次出现。

我在Mac上使用RStudio。

> head(Merged_Columns.m)
    SYMBOL Cond variable    value
1    Baz2b    T       0h  40.5629
2     Tpm4    T       0h  44.8539
3    H2-K1    T       0h 218.9180
4    Usp22    T       0h  23.6377
5     Mreg    T       0h  95.8775
6 Arhgap30    T       0h  40.1333

p <- ggplot(Merged_Columns.m, aes(variable, value, colour=Cond)) + geom_point() 
p + theme_bw(base_family= 'Helvetica') + facet_wrap(~SYMBOL,ncol = 2) + scale_y_continuous(trans = log2_trans(),
                                                      breaks = trans_breaks("log2", function(x) 2^x),
                                                      labels = trans_format("log2", math_format(2^.x))) +
 theme(axis.text.x  = element_text(angle=90)) +
  labs(title="10 > CPM > 8", x= "Time (h)" , y= "Expression (log2)")


Error in grid.Call(L_textBounds, as.graphicsAnnot(x$label), x$x, x$y,  : 
  polygon edge not found

- BioMan

Answer 1

我可以在Mac 1.2.5019上的RStudio中运行你的小样本代码，并不时地复现你的错误。

问题可能与此问题相同，该问题指向底层图形代码中显示表达式标签的一些低级错误，尤其是使用math_format()和上标。自您最初发布以来，这个问题已经引起了维护者的一些关注和增量修复，虽然它可能还没有完全解决。

你应该怎么做?

1. 确保你正在使用最新的RStudio，以确保你获得未来错误修复的好处。
2. 当使用某些表达式组成ggplot2中的标签时要注意。

这并不是一个解决方案，但如果你从scale_y_continuous()中完全删除labels = ...参数，或选择另一种格式，希望你不会收到同样的错误。

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还有一个关于字体可用性的问题在SO上(Error in grid.Call(L_textBounds, as.graphicsAnnot(x$label), x$x, x$y, : Polygon edge not found)，虽然该错误消息有额外的警告，并且在你的例子中似乎没有问题。

- ravic_

Answer 2

我曾经遇到过hrbrthemes（基于ggplot）的类似问题，阅读日志后，我发现了这个消息：

NOTE: Either Arial Narrow or Roboto Condensed fonts are required to use these themes.
  Please use hrbrthemes::import_roboto_condensed() to install Roboto Condensed and
  if Arial Narrow is not on your system, please see ...

确保安装了特定的字体，对我来说 hrbrthemes::import_roboto_condensed() 起到了作用。

- Kranja