如何修复'TypeError: hasattr(): attribute name must be string'错误？

Question

如何修复'TypeError: hasattr(): attribute name must be string'错误？

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我有以下代码：

import pymc as pm
from matplotlib import pyplot as plt
from pymc.Matplot import plot as mcplot
import numpy as np
from matplotlib import rc

res = [18.752, 12.450, 11.832]

v = pm.Uniform('v', 0, 20)

errors = pm.Uniform('errors', 0, 100, size = 3)

taus = 1/(errors ** 2)

mydist = pm.Normal('mydist', mu = v, tau = taus, value = res, observed = True)

model=pm.Model([mydist, errors, taus, v, res])
mcmc=pm.MCMC(model) # This is line 19 where the TypeError originates
mcmc.sample(20000,10000)

mcplot(mcmc.trace('mydist'))

由于某些原因它无法工作，我遇到了“TypeError: hasattr(): attribute name must be string”错误，以下是跟踪信息：

 Traceback (most recent call last):

  File "<ipython-input-49-759ebaf4321c>", line 1, in <module>
runfile('C:/Users/Paul/.spyder2-py3/temp.py', wdir='C:/Users/Paul/.spyder2-py3')

  File "C:\Users\Paul\Miniconda3\lib\site-packages\spyderlib\widgets\externalshell\sitecustomize.py", line 685, in runfile
execfile(filename, namespace)

  File "C:\Users\Paul\Miniconda3\lib\site-packages\spyderlib\widgets\externalshell\sitecustomize.py", line 85, in execfile
exec(compile(open(filename, 'rb').read(), filename, 'exec'), namespace)

  File "C:/Users/Paul/.spyder2-py3/temp.py", line 19, in <module>
mcmc=pm.MCMC(model)

  File "C:\Users\Paul\Miniconda3\lib\site-packages\pymc\MCMC.py", line 82, in __init__
**kwds)

  File "C:\Users\Paul\Miniconda3\lib\site-packages\pymc\Model.py", line 197, in __init__
Model.__init__(self, input, name, verbose)

  File "C:\Users\Paul\Miniconda3\lib\site-packages\pymc\Model.py", line 99, in __init__
ObjectContainer.__init__(self, input)

  File "C:\Users\Paul\Miniconda3\lib\site-packages\pymc\Container.py", line 606, in __init__
conservative_update(self, input_to_file)

  File "C:\Users\Paul\Miniconda3\lib\site-packages\pymc\Container.py", line 549, in conservative_update
if not hasattr(obj, k):

TypeError: hasattr(): attribute name must be string

如何让代码正常运行并输出“mydist”？

编辑：我之前意外发布了错误的跟踪信息。

编辑2：问题可能出在变量res没有名字，因为它是一个数组，但我不知道如何给它分配一个名字，以使其正常工作。

- user4099407

回溯片段似乎不包含该错误。 - Daniel Roseman

@Daniel，我不小心发布了错误的内容，抱歉，我已经更改了。 - user4099407

2个回答

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您只需要将res定义为numpy数组即可：

res = np.array([18.752, 12.450, 11.832])

那么在这里，您将会得到一个错误：mcmc.trace('mydist')，因为mydist是观测数据，因此不被采样。您可能想要绘制其他变量...

- Ramon Crehuet

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可以查看英文原文，
原文链接

- Raniz · Accepted Answer

我必须承认我不熟悉pymc，但是将其更改为以下内容至少使应用程序运行：

mydist = pm.Normal('mydist', mu = v, tau = taus, value = res, observed = False)

mcmc=pm.MCMC([mydist, errors, taus, v, res])

这似乎是因为您将所有内容都包装在一个Model中，它是ObjectContainer的扩展，但由于您传递了一个列表，Container.py中的MCMCfile_items尝试使用replace将列表中的索引4分配给某个东西，但由于Model是ObjectContainer，它将键4分配给了它的__dict__，导致您遇到的奇怪的TypeError。删除包装的Model会导致MCMC正确地使用ListContainer。

现在，Model.py中可能存在一个错误，位于第543行，其中可观测随机变量没有存储在数据库中 - 表达式是for object in self.stochastics | self.deterministics:，但我怀疑它也应该包括self.observable_stochastics - 所以我需要将observable更改为False，否则最后一行会抛出KeyError。

我对pymc不够熟悉，无法确定它是否实际上是一个错误或期望的行为，所以我让您提交一个问题。