使用R语言复制文件

Question

作为在 Windows 下运行的 R 中执行的更大任务的一部分，我希望在目录之间复制选定的文件。是否可能在 R 中给出像 cp patha/filea*.csv pathb 这样的命令（请注意通配符，以增加乐趣）？

- gappy

Answer 1

我认为没有直接的方法（除非使用shell），但以下类似的方法通常对我有用。

flist <- list.files("patha", "^filea.+[.]csv$", full.names = TRUE)
file.copy(flist, "pathb")

注意：

• 我特意将操作分为两个步骤，它们可以合并。
• 请查看正则表达式：R使用真正的正则表达式，并将文件模式与路径分开为两个独立参数。
• 请注意正则表达式中的^和$（字符串的开头和结尾）——这是一个常见的错误，因为在通配符类型的模式中，这些内容是隐含的，但是在正则表达式中是必需的（以防选择一些文件名与通配符模式匹配，但同时以其他文本开头和/或结尾）。
• 在Windows世界中，人们通常会向list.files添加ignore.case = TRUE参数，以模拟此操作系统中目录搜索不区分大小写的事实。
• R的glob2rx()函数提供了一种将通配符模式转换为正则表达式的便捷方法。例如fpattern = glob2rx('filea*.csv')返回一个不同但等效的正则表达式。

- mjv

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我认为模式应该是"^filea.+[.]csv"。 - Marek

@Marek：你说得对！特别是在Windows世界中，人们通常会想要添加参数ignore.case = TRUE。我已经相应地进行了编辑，谢谢。 - mjv

你可以使用?glob2rx将通配符转换为正则表达式。 - Eduardo Leoni

@Edurardo Leoni：是的，你可以。关于R语言的好处之一是，你不断发现做事情的新方法，虽然有时会让人感到不安。这是我第一次听说在R中使用glob2rx；通常我会手写我的正则表达式（顺便说一下，对于globbing模式来说并不难），但是，是的，glob2rx()也可以工作。我将把这个内容添加到答案的注释中。 - mjv

如果您使用此功能来复制和替换文件，请不要忘记在file.copy()中添加overwrite = TRUE！我因此浪费了一个小时进行调试。 - micstr

Answer 2

你可以：

• 使用system()来执行一个命令，就像在shell中一样，包括globbing（文件名扩展）。
• 使用list.files()或者别名dir()手动进行globbing（文件名扩展）和正则表达式匹配，然后逐个复制文件。
• 按照mjv的回答所示，对单个文件使用file.copy。

- Dirk Eddelbuettel

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从来没有听说过 dir。它与 list.files 完全相同...奇怪同时存在两个。 - MichaelChirico