pip从哪里安装软件包？

Question

我需要使用pip下载Biopython包。我运行了pip install biopython，但出现了以下错误:

我确认问题是因为网络阻止了大多数网站的访问，因此在尝试通过pip和其他方式安装其他软件包时会遇到网络连接错误。要允许这些下载，我需要编译下载源的url列表并将其发送给网络管理员以解除阻止。

根据pip文档（在pip维基百科文章中引用并简要解释），“许多软件包及其依赖项可以在默认软件包源——Python Package Index(PyPI)中找到”，所以我转到Biopython的PyPI页面，并找到了github存储库和包所需的依赖项。PyPI页面上还有下载链接，我想确保所有下载源都被允许。所以，pip是否从软件包的原始来源（github存储库或其他位置）安装，从PyPI页面下的下载列表中列出的软件包安装，还是两者都搜索？

- Drops

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来自pip的错误101，这通常意味着您正在代理服务器后面工作。请查看此方法，手动安装： http://biopython.org/DIST/docs/install/Installation.html#htoc7 - Rahul Bharadwaj

我正在使用运行RHEL的服务器，并已经安装了python2和python34（以及相应版本的pip）。我也看到了使用tar安装的方法，但不会使用它，因为后续需要修补和解决依赖问题。感谢您的建议。 - Drops

Answer 1

一种解决方法是使用与网络不同的相同操作系统和Python版本的机器，在干净的目录中运行 python -m pip3 download biopython --dest .，这将下载适当的包以及它们所依赖的包。
之后，您可以在获取任何必需权限和病毒扫描后，将这些文件复制到您的防火墙机器上并运行 pip install <the files you downloaded>
或者，如果您只想找出涉及的所有URL，则可以使用（同样来自运行相同Python版本的操作系统外部的机器）捕获以下命令的输出：python -m pip3 download -v -v biopython --dest .，这将向您展示在下载包及其依赖项期间所访问的所有位置。

- Steve Barnes

Answer 2

pip正在从PyPi安装软件包。 在PyPi网站上，您可以找到指向GitHub的链接，其中包含完整的软件包代码，但pip下载的是PyPi。

- Eladtopaz

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我可以在Docker Ubuntu 18.04（FROM ubuntu:bionic-20200903）中成功安装 pygobject==3.26.1。但是我无法在Docker Ubuntu 20.04（FROM ubuntu:focal-20210921）上安装它。它显示：Could not find a version that satisfies the requirement pygobject==3.26.1。目前在PyPi上没有pygobject==3.26.1（我已经在该网站上手动检查过）。那么当pip在Ubuntu 18.04上运行时，它从哪里找到这个版本呢？顺便说一下，我使用的是pip3。 - Oleg Yablokov