使用MICE软件包进行多重插补后，汇总Cox PH结果

Question

我有一个包含生存数据和一些缺失协变量的数据集。我成功地应用了mice软件包，使用函数填补了m个数据集，创建了对象，并在每个m数据集上应用了Cox PH模型。随后，我使用函数汇总了结果。这引发了我的问题：

如何获得每个协变量的汇总估计的p值？它们是否隐藏在对象中？

我知道p值并不是一切，但只报告估计值和置信区间而没有相应的p值对我来说似乎很奇怪。我能够使用例如Altman提供的公式从置信区间计算出一个近似p值，但这似乎过于复杂。我搜索了答案，但我找不到任何人提到这个问题。我是忽略了一些明显的东西吗？

E.g.:

library(survival)
library(mice)
library(mitools)
test1 <- as.data.frame(list(time=c(4,3,1,1,2,2,3,5,2,4,5,1), 
          status=c(1,1,1,0,1,1,0,0,1,1,0,0), 
          x=c(0,2,1,1,NA,NA,0,1,1,2,0,1), 
          sex=c(0,0,0,0,1,1,1,1,NA,1,0,0)))

dat <- mice(test1,m=10)

mit <- imputationList(lapply(1:10,complete,x=dat))

models <- with(mit,coxph(Surv(time, status) ~ x + strata(sex)))

summary(MIcombine(models))

我尝试整理MIcombine对象的结构，但目前还没有找到p值。

- Kjetil Loland

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你尝试使用 str 方法检查你的对象了吗？也许你可以尝试 str(summary(your.object)) 看看里面是否有 p-value。无论如何，你能否提供一个最小可复现的示例，展示一下结果是什么样的（例如函数 MIcombine）？https://dev59.com/eG025IYBdhLWcg3whGSx - Roman Luštrik

是的，我尝试对结构进行排序，但没有成功。感谢您提供添加示例的提示！ - Kjetil Loland

Answer 1

models <- with(dat,coxph(Surv(time, status) ~ x + strata(sex)))
summary(pool(models))

- Andreu FG