R 3.0.1软件包构建警告

Question

我正在使用Rtools30和与RStudio相关的“Build”工具，在Windows机器上构建R 3.0.1的R包，我假设这与devtools（已更新）有关。我的典型打包过程是：

1. 加载全部
2. 重新生成文档
3. 构建并重新加载
4. 检查
5. 构建源代码包

如果一切顺利没有错误或警告，那么我会：

    install.packages("foo.tar.gz", repos=NULL, type="source")

自从升级到R 3.0.1版本以后，我现在收到了以下警告：

   Warning in install.packages : 
      foo.tar.gz is not available (for R version 3.0.1)

在安装之前，我也尝试过，但并没有消除警告：

    options(install.packages.check.source = FALSE)

此外，我在打开开发者工具库时注意到了这个警告：

    WARNING: Rtools 3.0 found on the path at c:/Rtools is not compatible with R 3.0.1.

很奇怪，Rtools 3.0应该适用于R >2.15.1至R 3.0.x

有任何想法是怎么回事吗？

- ldecicco

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这不是开发工具消息吗？看起来像是过度热情的抱怨，因为RTools（截至2013-06-09）已经更新到3.0版本，而R已经更新到3.0.1版本，所以用户没有太多需要做的。 - mdsumner

当您尝试从命令行安装 R CMD INSTALL foo.tar.gz 时会发生什么？ - Omar Wagih

命令行工作得很好！“在安装包中发出警告”的消息直接在install.packages调用之后出现...这是一个基本的R函数（不是devtools，对吧？） - ldecicco

Answer 1

由于 RStudio 编辑器对 utils 中的许多功能进行了包装和/或更改以实现更好的集成，因此此问题是 RStudio 特有的。问题出在调用 getDependencies() 来检查依赖项时。但是，该函数还将检查原始软件包是否存在于 CRAN 上，并在其不存在时抛出给定的警告。您刚刚在自己的计算机上构建的软件包显然不在 CRAN 上，因此会出现警告。

在本机 install.packages() 的源代码中，在从源代码构建或从不同存储库安装软件包的情况下，不会调用 getDependencies()。另一方面，RStudio 在将所有内容传递给本机 install.packages() 函数之前先调用 getDependencies()。

据我所知，这对其他影响没有进一步作用，除了让人困惑。我没有找到一种方便的方法来在 RStudio 中摆脱这个问题，因为由于 RStudio 处理方式的复杂性，suppressWarnings() 在这种情况下不起作用。

在基本的 R 控制台中，您不应该有任何问题。

因此，暂时忽略这个问题，并希望 RStudio 团队有时间处理这个小故障。

- Joris Meys

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供参考，此问题已在RStudio报告：http://support.rstudio.org/help/discussions/problems/5811-problem-installing-local-packages - Joris Meys